| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2295818 = | 40 (1.300) | 9 (0.360) | 7/222 | 2.1 | 23.4% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | 2295903 = | 26 (1.030) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
TCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA > NC_002947/2295673‑2295967 | gcgccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTgg > 1:481957‑M1/146‑150 (MQ=255) gccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGa > 1:249764‑M1/144‑150 (MQ=255) ccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAg < 1:274919‑M1/8‑1 (MQ=255) gggttgccggtgccgaaccggagtgtttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCg > 2:56396‑M1/141‑150 (MQ=255) tGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTTGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCgg < 1:20364/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGAAAGCAGTACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCgg < 1:174211/150‑1 (MQ=255) ggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGcc > 2:115609‑M1/133‑150 (MQ=255) tcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCcgcg < 1:296165‑M1/22‑1 (MQ=255) gaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa < 1:350138‑M1/24‑1 (MQ=255) gttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCagag < 1:139040‑M1/35‑1 (MQ=255) agcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGCACACCGGCAGAGcc > 2:170875/1‑150 (MQ=255) gcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTTGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAACGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCg > 1:608040/1‑150 (MQ=255) tGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCa > 1:31038/1‑150 (MQ=255) tGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATCCCCCCGAACACCGGCAAACCCGGGGCCATCCa > 2:536612/1‑150 (MQ=255) ccacAGCTACACCGAGCAGTACCTGAGCCAGAGTGCCAACTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGTTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCgg < 1:189978/150‑1 (MQ=255) tACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAGCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGc > 1:157773/1‑150 (MQ=255) cacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑tt > 2:358717/1‑150 (MQ=255) taGCAGTACCTGCGCCCGAGCGCCAATTTACATGAGGCACTGAGTGGCAAGCACCACCACTGCTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTcgcg < 2:157773/149‑1 (MQ=38) gAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTcgcg < 1:146206/150‑1 (MQ=255) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCgg > 2:296165‑M1/83‑150 (MQ=255) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCgg > 2:139040‑M1/83‑150 (MQ=255) gCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCggg > 2:350138/1‑150 (MQ=255) gctggaggggtggctggcttcggagctgttgaaggcaatcatggtccgctgagtaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCa > 1:372186‑M1/80‑150 (MQ=255) aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCa < 1:358717/150‑1 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCAt < 1:123364/150‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATc < 2:21604/122‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATc > 1:21604/1‑122 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGcc > 1:402734/1‑150 (MQ=255) gggggtggctggtttcggtgttgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcttTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGccc > 2:267478‑M1/75‑150 (MQ=255) tGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCg > 1:233663/1‑150 (MQ=255) ctggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:724921‑M1/71‑150 (MQ=255) gctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGAGGTGCACGC‑TTTGCGGGCGTGCCGGctccag < 2:724921‑M1/83‑3 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAc < 2:233663/150‑1 (MQ=255) aaTTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAcc < 2:402734/150‑1 (MQ=255) gctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTgg > 2:405694‑M1/56‑60 (MQ=255) gctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTgg < 1:405694‑M1/5‑1 (MQ=255) cGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGc < 2:31038/150‑1 (MQ=255) gCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGccc < 1:679795/150‑1 (MQ=255) aggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCgg > 1:117567‑M1/48‑115 (MQ=255) aggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCgg < 2:117567‑M1/68‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa > 1:328787/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGCAACCCCCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGCCCTTGTGGGAGCGAACCTGCCCGCGAACACCAGCATCGCCGGTGCCATGCACCTCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGGATGCTCTCTACGACCCGCTCCCGTGTGCAGCCCGagg > 2:195010/1‑148 (MQ=255) tGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTa > 2:578390/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTa < 2:49259/150‑1 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt > 1:48863/1‑140 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt < 2:48863/140‑1 (MQ=255) tGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCAt > 1:709207/1‑95 (MQ=255) tGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCAt < 2:709207/95‑1 (MQ=255) ggCTTGTGTGAGGTCCTTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGCACCCCGGCAGAGTCGATGCTACCTGCCGCGGTGCCCGA‑TTCGCGGGAATGCCCGCTCCCACACTAACCGATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 1:578390/150‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCGCGCACACGGGCCCATGTGCAGCGGGATGTTTGATCAGCGGACCATGATTGCCtta > 2:344856/1‑149 (MQ=37) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg > 1:608750/1‑111 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 2:608750/111‑1 (MQ=255) tgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt < 1:620818/143‑1 (MQ=255) tgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt > 2:620818/1‑143 (MQ=255) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa > 1:22188/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc < 2:459422/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc > 1:459422/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGAGGTGCACGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc > 1:28255/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGAGGGCATGCTCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGAAGCGCTAGCGTTCG‑GTGTAGGCCTGGTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCTGCTGTCCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagcca < 1:170875/150‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagcca < 1:556169‑M1/150‑1 (MQ=255) | TCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA > NC_002947/2295673‑2295967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |