| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,851,242 | G→T | 100% | E96* (GAG→TAG) | relA → | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,851,242 | 0 | G | T | 100.0% | 63.4 / NA | 22 | E96* (GAG→TAG) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (11/11); total (11/11) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTA > NC_002947/1851100‑1851385 | gaAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCaa < 1:453429/150‑1 (MQ=255) aaaGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGACGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGt > 1:644164/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCg > 2:333448/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCgg < 2:651401/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCgg < 1:522497/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCAGAGGTCAGCCAGCgg > 2:522497/1‑150 (MQ=255) aTGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGcc > 1:696856/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCGCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCggtggt < 2:284263/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACGCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGTGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCggtggt > 2:85371/1‑150 (MQ=255) gCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCa > 1:143659/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGc < 1:294549/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCt < 2:143659/150‑1 (MQ=255) cGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgt < 1:338060/139‑1 (MQ=255) cGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgt > 2:338060/1‑139 (MQ=255) gtggCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTg < 1:437349/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTg > 2:229503/1‑150 (MQ=255) tGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTAACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCt > 1:140105/1‑150 (MQ=255) ggTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCGATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTggg < 1:85371/150‑1 (MQ=255) aTCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcg > 2:549392/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAg > 2:243273/1‑124 (MQ=255) cTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAg < 1:243273/124‑1 (MQ=255) gTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTa < 2:696856/150‑1 (MQ=255) | GAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTA > NC_002947/1851100‑1851385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |