New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1119638 = | 44 (1.200) | 9 (0.250) | 9/264 | 2.6 | 17.4% | coding (626/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase |
? | NC_002947 | 1119667 = | 43 (1.210) | coding (597/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGCCTTTTTGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGC > NC_002947/1119490‑1119783 | gccgcgcgcgctgaaaaaggtcaccctgctggccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgacctacctttgccacccaAg > 1:891149‑M1/149‑150 (MQ=255) cgccCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCt > 2:592972/1‑150 (MQ=255) cgccCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCt > 1:267657/1‑150 (MQ=255) gccCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGGTCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTg > 2:105851/1‑150 (MQ=255) ccTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGtt > 1:899426/1‑150 (MQ=255) ggTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGGCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑gg > 1:277640/1‑150 (MQ=255) cACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCt > 2:887994/1‑150 (MQ=255) cACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCt > 2:124076/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTgg < 1:242552/150‑1 (MQ=255) gccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTACCTGGCCTGTTC‑GGCCAGGt > 1:663150‑M1/118‑142 (MQ=255) gccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTACCTGGCCTGTTC‑GGCCAGGt < 2:663150‑M1/25‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGt > 1:794796/1‑150 (MQ=255) gCGTGGCGGCTGGTCGCTTCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCa > 1:421030/1‑150 (MQ=255) aaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTg < 1:414164‑M1/35‑1 (MQ=255) aaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTg > 2:414164‑M1/112‑146 (MQ=255) ccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccaccccAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTggg < 2:155516‑M1/33‑1 (MQ=255) ccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccaccccAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTggg > 1:155516‑M1/108‑140 (MQ=255) ccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCt < 2:567197‑M1/4‑1 (MQ=255) ccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCt > 1:567197‑M1/108‑111 (MQ=255) cTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTggg < 1:124076/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGggcgg > 1:95117/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGggcggc > 2:812664/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGc > 1:380438/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCtt < 2:367136/121‑1 (MQ=255) cTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCtt > 1:367136/1‑121 (MQ=255) gCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAg < 2:614533/150‑1 (MQ=255) aCGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTcg > 1:335438/1‑150 (MQ=255) gCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCgg < 1:105851/150‑1 (MQ=255) gTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGt > 1:852916/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAg > 1:82673/1‑150 (MQ=255) cccAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTg > 2:802123/1‑150 (MQ=255) tcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGt < 2:595886‑M1/34‑1 (MQ=255) tcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGt > 1:595886‑M1/63‑96 (MQ=255) ccAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTgg < 1:802123/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTgg > 1:266023/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCTTAATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTgg > 1:446144/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTg < 1:121383/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCACGGTGGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGACGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTgg > 1:384884/1‑150 (MQ=255) tttttCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCa > 1:71387/1‑150 (MQ=255) ctcGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCtt < 2:794796/150‑1 (MQ=255) tcGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCATTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGggcggc > 2:520977/1‑93 (MQ=255) tcGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCATTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGggcggc < 1:520977/93‑1 (MQ=255) tCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGAcc > 2:737484/1‑150 (MQ=255) ccAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCg > 2:349544/1‑150 (MQ=255) cTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCAt > 1:623589/1‑112 (MQ=255) cTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCAt < 2:623589/112‑1 (MQ=255) ttCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTc > 2:660876/1‑150 (MQ=255) cAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGGTGGCATGCTTGACCGCACGCTcta < 2:335438/150‑3 (MQ=255) ttGAGGGCCTTCGGCGCCTTGCCCAGCTCCTGGGCCGGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCg < 1:592972/150‑1 (MQ=255) gAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGc < 2:277640/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGc > 1:548905/1‑150 (MQ=255) tgCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCt < 2:899426/150‑1 (MQ=255) tttgccacccaAGCTACCTGGCC‑GAACAGGCCAAGGAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCtt < 2:507952‑M1/139‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCg < 2:421030/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCg < 1:887994/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGc < 1:737484/150‑1 (MQ=255) | GGCCTTTTTGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGC > NC_002947/1119490‑1119783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |