New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4870735 | 32 (1.380) | 5 (0.270) | 4/200 | NT | 16.5% | intergenic (+40/‑80) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | = 4870755 | 25 (1.350) | intergenic (+60/‑60) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
GATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATC > NC_002947/4870588‑4870883 | gATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAAGAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCg > 1:569303/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGa < 1:213322/150‑1 (MQ=255) aTGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCACATGCGCAAGGCAGTAGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGa < 1:292748/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgc < 2:418754‑M2/150‑8 (MQ=255) tGCGGTGTGGCTGCGAGCAGATTCGCAAGGCAGTGGCCGAAACACAGCCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgc > 1:245790‑M2/1‑143 (MQ=255) cTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgg > 1:418754‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCATGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGATTGtagggttggagctgatatcgcattcgcgg < 2:226797‑M1/150‑30 (MQ=255) gAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGATTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctc < 1:317705‑M2/150‑22 (MQ=255) cAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctccta > 1:437587‑M2/1‑126 (MQ=255) aGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctcctac < 1:93574‑M2/150‑26 (MQ=255) tctcgcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCa < 1:377918/147‑1 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGt > 1:251072/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAAATGGAAACCAAAACCACCTAACAGCGCTTTAACTATTTCGTATTTGTAGTACTCATGAAGTTTATATCAGCTCCTACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgaga > 2:377918/1‑147 (MQ=255) gCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGgca < 2:204708/150‑1 (MQ=255) tgccTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTcc < 1:538991/100‑1 (MQ=255) tGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTcc > 2:538991/1‑103 (MQ=255) gAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCtt < 2:569303/150‑1 (MQ=255) aaaCACAGTCGCGCGAACGGGAACTTGAAACCATCCCCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTa < 1:341018/150‑1 (MQ=255) aaCACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCTCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTag > 2:372604/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGt > 2:65765/1‑150 (MQ=255) tCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGtt < 2:93574/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGtt < 2:317705/150‑1 (MQ=255) gggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATAGCAGCTCCAACGATACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCa > 1:380915/1‑150 (MQ=255) ggAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcggg > 1:496124‑M1/1‑59 (MQ=255) ggAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcggg < 2:496124‑M1/89‑31 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa < 2:155511/150‑1 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa > 2:180104/1‑150 (MQ=255) aCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAg < 2:578089/103‑1 (MQ=255) aCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAg > 1:578089/1‑103 (MQ=255) cATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgg < 2:124689‑M1/82‑30 (MQ=255) cATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgg > 1:124689‑M1/1‑53 (MQ=255) cATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAAc > 1:392900/1‑150 (MQ=255) aTCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACg > 1:402199/1‑150 (MQ=255) tCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATGCCTGGGTGCATCAGGT‑CGACCATGGTCCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGc > 1:534608/1‑150 (MQ=255) cccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCACGGCTGAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCt > 1:6051/1‑150 (MQ=255) cccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCg > 1:220053/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGt > 1:209647/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCGAACGGTAGATTGGCGGGTAAAAGCGCTCGTAGGAGGGG‑CGGCAGGATGGGTTAGAGAGGTTGCATCATGGATGAATGGATTAATGTACTCGCCGACCACCATTCCCGTg > 2:212216/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatct < 1:93574‑M1/150‑126 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatctg > 1:437587‑M1/1‑24 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGa > 1:472720/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 2:348452/72‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 1:348452/1‑72 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaatcccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatctgctc < 1:317705‑M1/150‑130 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTg < 2:209647/150‑1 (MQ=255) cccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttcc < 2:496124‑M2/89‑60 (MQ=255) cccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttcc > 1:496124‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGCGAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatctgctcgcagccccacag > 1:418754‑M1/1‑9 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatg < 2:124689‑M2/82‑54 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatg > 1:124689‑M2/1‑29 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGt > 1:392860/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCa < 2:566042/56‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCa > 1:566042/1‑56 (MQ=255) ccGCGAATGCGATATCAGCTCCAACCCTAcaatcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcatggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatctgctcgcagccccacag < 2:226797‑M2/150‑122 (MQ=255) gcgAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcggctgtgtttcggccactgccttgcgaatctgctcgcagccacaccgca > 1:245790‑M1/1‑7 (MQ=255) gcgAATGtagcgttggagctgatatcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaagggccttgcgttgtcagggggtgatggtttccagttcccgttcgcgcgactgtgtttcagccactgccttgcgcatctgctcgcagccccacagca < 2:418754‑M1/150‑144 (MQ=255) gcgAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGa < 2:153528/150‑1 (MQ=255) tGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTAGTGACcatc < 2:402199/150‑1 (MQ=255) | GATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGT‑CGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATC > NC_002947/4870588‑4870883 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |