New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 25741 = | 38 (1.640) | 4 (0.190) | 4/230 | NT | 11.0% | intergenic (+171/‑140) | PP_0020/PP_0021 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 25779 = | 30 (1.410) | intergenic (+209/‑102) | PP_0020/PP_0021 | hypothetical protein/hypothetical protein |
AGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGAT > NC_002947/25592‑25886 | atgatcttgctttctgtgtcttcgatgcggaccttatagacatccatctttgctgaaaccgtatcaatagagggtctctggatggtaacgagcgaggataggcagcagtaggcctaactgacccttttggtggtcacccactggtttgag > 2:179536‑M1/150‑150 (MQ=255) tCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGgccc > 1:319026/1‑150 (MQ=255) gTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCa > 1:593713/1‑150 (MQ=255) tttGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAg > 1:502048/1‑150 (MQ=255) tGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGt < 2:319026/150‑1 (MQ=255) tGACCTTAGCTGACCGGCTGCCCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGTCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCCCCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGt < 1:520054/150‑1 (MQ=255) tcttcgatgcggaccttatagacatccatctttgctgaaaccgtatcaatagagggtctctggatggtaacgagcgaggataggcagcagtaggcctaactgacccttttggtggtcacccactggtttgaGGCCCGCCCAGGTCGATCa < 1:193137‑M1/19‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAgg < 2:138538/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCtt > 2:453736/1‑150 (MQ=255) gctgctCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCttt < 1:453736/150‑1 (MQ=255) ctctACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAg > 2:153418/1‑137 (MQ=255) ctctACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAg < 1:153418/137‑1 (MQ=255) ccatctttgctgaaaccgtatcaatagagggtctctggatggtaacgagcgaggataggcagcagtaggcctaactgacccttttggtggtcacccactggtttgaGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAAc > 2:193137‑M1/107‑150 (MQ=255) ttttCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCTTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTgg < 2:237286/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAg > 2:416369/1‑150 (MQ=255) tCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggcgg < 1:351345/107‑1 (MQ=255) tCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggcgg > 2:351345/1‑107 (MQ=255) cAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAgg > 2:2015/1‑145 (MQ=255) cAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAgg < 1:2015/145‑1 (MQ=255) aaGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTAct > 1:308338/1‑150 (MQ=255) gAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGacc > 1:254518/1‑123 (MQ=255) gAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGacc < 2:254518/123‑1 (MQ=255) tAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACtgctgc < 1:490294/150‑1 (MQ=255) tAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACtgctgc > 2:490294/1‑150 (MQ=255) cccccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGt < 1:588689/113‑1 (MQ=255) cccccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGt > 2:588689/1‑113 (MQ=255) gagcgaggataggcagcagtaggcctaactgacccttttggtggtcacccactggtttgaGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggcgggc > 2:592885‑M1/61‑97 (MQ=255) gagcgaggataggcagcagtaggcctaactgacccttttggtggtcacccactggtttgaGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggcgggc < 1:592885‑M1/37‑1 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCaaa < 1:569947/102‑1 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCaaa > 2:569947/1‑102 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTgg < 2:100643/109‑1 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTgg > 1:100643/1‑109 (MQ=255) ccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggc > 1:333545/1‑91 (MQ=255) ccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTgggc < 2:333545/91‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATcc > 1:53642/1‑150 (MQ=255) ccAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACAAACGGGTGACCCCGGATGGAATGAGTTAGGTCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCag > 1:599483/1‑150 (MQ=255) cAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACtgctgc < 2:295253/125‑1 (MQ=255) cAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACtgctgc > 1:295253/1‑125 (MQ=255) gACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAgaga < 2:502048/150‑1 (MQ=255) cTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCAGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCATTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGGTCGTTACCATCCAGAGAccc > 2:260080/1‑150 (MQ=255) tACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCctct > 1:539085/1‑150 (MQ=255) tcACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATACAGAGACCCTCTATTGAt > 2:421891/2‑150 (MQ=255) gggggTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGtt < 2:539085/150‑1 (MQ=255) ttgttTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAg > 1:167967/1‑150 (MQ=255) cTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAgatggat < 1:416369/150‑1 (MQ=255) gggCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGAcc < 2:286102/116‑1 (MQ=255) gggCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGAcc > 1:286102/1‑116 (MQ=255) | AGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGAT > NC_002947/25592‑25886 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |