New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2503015 = | 25 (1.080) | 3 (0.140) | 3/238 | NT | 10.8% | coding (267/936 nt) | speB | agmatinase |
? | NC_002947 | 2503057 = | 26 (1.180) | coding (309/936 nt) | speB | agmatinase |
TTCGGCCCGCGGGCGATCCGTGCTGCCTCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATCCATTTCGATGCGCACAGT > NC_002947/2502908‑2503201 | ttCGGCCCGCGGGCGATCCGTGCTGCCTCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGGCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGc > 1:536262/1‑150 (MQ=255) ggcgggcgtgagcattgagcagcgggtagctgatgaagtggtcgccaccaagggtcagcatggcgcaacccgcctgcagaatgtgctcggcatgggcctcgatgCTGCCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATc > 2:504197‑M1/105‑150 (MQ=255) gTGCTGCCTCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGc < 1:425087/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACACGTTCGGCGACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTc > 1:352578/1‑150 (MQ=255) tCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCAGATCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCtt > 2:86934/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTgc > 1:87063/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAgg > 1:70894/1‑116 (MQ=255) cTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAgg < 2:70894/116‑1 (MQ=255) tcgccaccaagggtcagcatggcgcaacccgcctgcagaatgtgctcggcatgggcctcgatgCTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCa < 1:517806‑M1/44‑1 (MQ=255) tcgccaccaagggtcagcatggcgcaacccgcctgcagaatgtgctcggcatgggcctcgatgCTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCa > 2:517806‑M1/64‑107 (MQ=255) ggCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGa < 1:402905/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGAc < 2:536262/150‑1 (MQ=255) acccgttcgaccACCGGGCGGTCAGCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGCCAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTtca < 1:272709/150‑1 (MQ=255) ccgttcgaccACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTtcatc > 2:512376/1‑150 (MQ=255) ggTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAg > 1:380346/1‑67 (MQ=255) ggTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAg < 2:380346/67‑1 (MQ=255) gTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAg < 1:512376/150‑1 (MQ=255) tCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAgg < 2:521082/150‑1 (MQ=255) tATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCAcgcc > 2:585869/1‑150 (MQ=255) gatgctgtccggtaccgactgcggcgtgccgctgtcgaaggggcagCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAATGCTCAcgcccgcc > 2:504197‑M2/47‑150 (MQ=255) tgctgtccggtaccgactgcggcgtgccgctgtcgaagggacagCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGa > 2:517806‑M2/45‑107 (MQ=255) tgctgtccggtaccgactgcggcgtgccgctgtcgaagggacagCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGa < 1:517806‑M2/63‑1 (MQ=255) CCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGcc < 1:601804‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCt < 1:518217/63‑1 (MQ=255) cTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCt > 2:518217/1‑63 (MQ=255) ttCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACAt < 1:387614/59‑1 (MQ=255) ttCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACAt > 2:387614/1‑59 (MQ=255) gCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGc > 2:231496/1‑54 (MQ=255) gCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGc < 1:231496/54‑1 (MQ=255) gCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGa < 1:413782/150‑1 (MQ=255) gtgccgcTGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATc > 2:332904/3‑150 (MQ=255) gccgcAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGGTGTTCCa > 1:61503/1‑150 (MQ=255) ctgTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATCCATTTc < 1:332904/148‑1 (MQ=255) ggTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATCCATTTCGATgc > 2:282191/1‑150 (MQ=255) gacagCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATCCATTTCGATGCGCACAGt > 1:554030‑M2/6‑150 (MQ=255) cATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTtg < 2:285276/56‑1 (MQ=255) cATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTtg > 1:285276/1‑56 (MQ=255) | TTCGGCCCGCGGGCGATCCGTGCTGCCTCGGTCCAGCAGGCCTGGGCCCGCCACTGGCCGTGGGCGTTCGACCCGTTCGACCACCTGGCGGTCATCGACTATGGCGACTGTCCCTTCGACAGCGGCACGCCGCAGTCGGTACCGGACAGCATCGAGGCCCATGCCGAGCACATTCTGCAGGCGGGTTGCGCCATGCTGACCCTTGGTGGCGACCACTTCATCAGCTACCCGCTGCTCAAGGCTCACGCCCGCCGCCATGGCCCGCTGGCGCTGATCCATTTCGATGCGCACAGT > NC_002947/2502908‑2503201 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |