New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5987958 | 32 (1.380) | 3 (0.140) | 3/236 | NT | 8.4% | coding (984/1788 nt) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
? | NC_002947 | = 5987978 | 35 (1.600) | coding (1004/1788 nt) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
CCTGCTGCTGGAAATGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGATGCTGGGTT > NC_002947/5987844‑5988118 | ccTGCTGCTGGAAATGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTgg < 2:51652/150‑1 (MQ=255) tGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCg < 1:403732/150‑1 (MQ=255) ccACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGc > 1:222152/1‑143 (MQ=255) ccACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGc < 2:222152/143‑1 (MQ=255) gggCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCACCTTCGTGGTGTTCAAGCTggg < 2:502445/150‑1 (MQ=255) gCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCa > 2:379768/1‑150 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTTGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGtt < 1:309724/134‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGtt > 2:309724/1‑134 (MQ=255) tggtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAACTCGccaccgg < 1:343091/118‑6 (MQ=255) tggtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAACTCGccaccgg > 2:343091/1‑113 (MQ=255) gtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTTGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCaa < 2:9339/125‑1 (MQ=255) gtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTTGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCaa > 1:9339/1‑125 (MQ=255) ggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGa > 2:89446/1‑150 (MQ=255) gCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTctga < 1:21538/150‑4 (MQ=255) aGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGAGAAAGCGTTCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGa > 1:76193/1‑150 (MQ=255) gctgctGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGAc < 1:379768/150‑1 (MQ=255) tgctgTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCt < 2:358334/150‑1 (MQ=255) ttGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTc < 1:214237/132‑1 (MQ=255) ttGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTc > 2:214237/1‑132 (MQ=255) aGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctgctgct < 2:293236/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctgctgctg < 1:89446/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggt < 2:515894/88‑1 (MQ=255) tCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggt > 1:515894/1‑88 (MQ=255) gCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGc < 1:212766/110‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGc > 2:212766/1‑110 (MQ=255) gcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATgg > 2:241486/1‑150 (MQ=255) gcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCAAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCACTgg > 2:49592/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTgctggcgctgttcaggccgccgaccaagcggccgacgcctatcagcaacagcagcttcacggccaccagcaacagggtcaggcccagcaccaccagtggcatttccagcagcaggcgca < 2:352520‑M2/150‑120 (MQ=255) gccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCg > 1:592108/1‑150 (MQ=255) ccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCgc > 2:242712/1‑150 (MQ=255) agcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCgctg > 1:344758/1‑150 (MQ=255) gcgccCTGCGCCTGGGCATGGTgctggcgctgttcaggccgccgaccaagcggccgacgcctatcagcaacagcagc > 2:296355‑M2/1‑22 (MQ=255) gcgccCTGCGCCTGGGCATGGTgctggcgctgttcaggccgccgaccaagcggccgacgcctatcagcaacagcagc < 1:296355‑M2/77‑56 (MQ=255) cccTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGa < 2:112775/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGAt > 1:595119/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 1:457441/119‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc > 2:457441/1‑119 (MQ=255) tGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGATGCTGGGtt < 1:241486/150‑1 (MQ=255) | CCTGCTGCTGGAAATGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGATGCTGGGTT > NC_002947/5987844‑5988118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |