New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1551725 = | 33 (1.430) | 3 (0.140) | 3/234 | NT | 9.4% | coding (1139/1455 nt) | pykA | pyruvate kinase II |
? | NC_002947 | 1551778 = | 27 (1.250) | coding (1086/1455 nt) | pykA | pyruvate kinase II |
TGGGTGGCGCGGTGCGGCGACAGGGCGAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGCCGACAGCATCAC > NC_002947/1551629‑1551927 | gccatggcacgcatctgcctgggtgccgaaaagcacccgaccagccagaagtccagccatcgcctgcacaccaccttccagcgctgcgacgaaagcATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATg > 2:402293‑M1/97‑150 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGCGACAGGGCGAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTtc < 1:551560/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGCGACAGGGCGAAGAACGGGACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTtc < 1:157148/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGGCGACAGGGCGAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTtcgtc > 1:213171/1‑150 (MQ=255) gCGAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAggtg > 2:567123/1‑150 (MQ=255) gAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGCGCCTCGTCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAggtggt < 1:568505/150‑1 (MQ=255) cGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAg < 1:496090/150‑1 (MQ=255) cATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGAt < 1:293293/150‑1 (MQ=255) gAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTg < 1:594156/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGAc < 2:314003/150‑1 (MQ=255) gcgACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCGCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGGAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTctggc > 1:191776/1‑150 (MQ=255) gcgACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTctggc < 2:213171/150‑1 (MQ=255) agccatcgcctgcacaccaccttccagcgctgcgacgaaagcATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTtcgtcg < 1:189430‑M1/63‑1 (MQ=255) agccatcgcctgcacaccaccttccagcgctgcgacgaaagcATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTtcgtcg > 2:189430‑M1/43‑105 (MQ=255) aTGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTc > 2:106709/1‑150 (MQ=255) ggTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAGCGCGTTGCTTTCGTCGCAGCGCTGAAAGGTCCGGTGCGGGCTTTGTCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTc > 1:139052/1‑150 (MQ=255) ggTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTc < 2:197991/150‑1 (MQ=255) tAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCa > 1:290174/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCAcc > 2:60492/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCAcc > 1:300394/1‑150 (MQ=255) cgacgaaagcatcgccttggcggccatgtacactgccaaccacttcccgggcgtaaaggcgatGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCt < 1:189430‑M2/42‑1 (MQ=255) cgacgaaagcatcgccttggcggccatgtacactgccaaccacttcccgggcgtaaaggcgatGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCt > 2:189430‑M2/64‑105 (MQ=255) ggCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCt > 1:154691/1‑63 (MQ=255) ggCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCt < 2:154691/63‑1 (MQ=255) ggCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTc > 1:319317/1‑129 (MQ=255) ggCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTc < 2:319317/129‑1 (MQ=255) gatCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTct < 2:299494/104‑1 (MQ=255) gatCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTct < 2:299657/104‑1 (MQ=255) gatCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTct > 1:299657/1‑104 (MQ=255) gatCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTct > 1:299494/1‑104 (MQ=255) catcgccttggcggccatgtacactgccaaccacttcccgggcgtaaaggcgatGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGc > 2:402293‑M2/55‑150 (MQ=255) CGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTg > 2:139080‑M1/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCt < 2:300394/150‑1 (MQ=255) gtgtACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGa < 1:472609/133‑1 (MQ=255) gtgtACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGa > 2:472609/1‑133 (MQ=255) aCATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGgcgc > 2:176887/1‑150 (MQ=255) ccgccAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCgg < 2:139052/150‑1 (MQ=255) cgccAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGc > 1:517650/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGCCg < 2:290174/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGCCGa < 1:567123/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGCCATAGACTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGCCGACAGCATCAc > 1:580231/1‑150 (MQ=255) | TGGGTGGCGCGGTGCGGCGACAGGGCGAAGATCGGTACATGCGAACGCAGGCGCGACATGATCAGCGGGGTGTAGCCGCTTTCGGTCAGGGCGATGATCGCCTTTACGCCCGGGAAGTGGTTGGCAGTGTACATGGCCGCCAAGGCGATGCTTTCGTCGCAGCGCTGGAAGGTGGTGTGCAGGCGATGGCTGGACTTCTGGCTGGTCGGGTGCTTTTCGGCACCCAGGCAGATGCGTGCCATGGCCTGGACAGCTTCGATCGGGTAGGAACCGGCGGCGCTTTCGGCCGACAGCATCAC > NC_002947/1551629‑1551927 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |