| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4861197 | 98 (0.890) | 30 (0.340) | 18/214 | 5.3 | 28.5% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | = 4861238 | 71 (0.800) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 | tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:2742543/1‑150 (MQ=255)tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:293653/1‑150 (MQ=255) aGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg < 1:2203403/150‑1 (MQ=255) aGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg < 1:1152856/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGc < 2:1232120/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc < 1:100683/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc > 1:273645/1‑150 (MQ=255) cGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTa > 1:675926/1‑150 (MQ=255) gAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAg < 2:519645/150‑1 (MQ=255) tACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCgg < 1:2742543/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt < 1:1216152/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTg < 1:2045264/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 2:2255330/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 2:835739/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 1:1077419/1‑150 (MQ=255) gTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 1:1250267/1‑133 (MQ=255) gTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt < 2:1250267/133‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 2:1327555/150‑1 (MQ=255) cggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAcc < 1:2566234/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGGTGCAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCt > 1:147114/1‑150 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGTGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGc < 2:116153/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGGAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTACAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCg‑g < 2:760963/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCg‑g < 2:1203110/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCTCTCCCACAAg < 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tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 2:1131621/126‑1 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc > 1:1131621/1‑126 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGa > 1:1128677/1‑150 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGaa < 2:1077419/150‑1 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGaa < 2:1128677/150‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc > 2:2337842/1‑108 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc < 1:2337842/108‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCg‑gg < 2:1960830/137‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCg‑gg > 1:1960830/1‑137 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAag > 2:1691599/1‑150 (MQ=255) tacaaagcagaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCATGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAAGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAaga < 2:293653/148‑1 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAaga < 1:2285412/150‑1 (MQ=255) ggcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCTAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAaga < 2:2002592/149‑1 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTc > 2:1659265/1‑95 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTc > 2:1657098/1‑95 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTc < 1:1657098/95‑1 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTc < 1:1659265/95‑1 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCAGTAGGAGGG‑GACTTACCAGCAAAGAGAcc > 2:1404443/1‑150 (MQ=39) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGc > 2:546968/1‑145 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:546968/145‑1 (MQ=255) gcagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCt > 1:24347/1‑94 (MQ=255) gcagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCt < 2:24347/94‑1 (MQ=255) gcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACGGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacg > 2:1612711/1‑150 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 2:700692/143‑1 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAg > 1:700692/1‑143 (MQ=255) ggggTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAagag < 1:1814162/130‑1 (MQ=255) ggggTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAagag > 2:1814162/1‑130 (MQ=255) gtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTCAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCg < 2:731597/150‑1 (MQ=255) tGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCg > 2:1423641/1‑150 (MQ=255) gggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc < 2:147114/150‑1 (MQ=255) 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gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 2:575121/1‑104 (MQ=255) gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctg > 2:380404/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc < 1:1558096/149‑1 (MQ=255) aCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGtt > 2:2435333/1‑85 (MQ=255) aCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGtt < 1:2435333/85‑1 (MQ=255) aCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc > 1:89971/1‑150 (MQ=255) 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tCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgc < 2:1752999/132‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgc > 1:1752999/1‑132 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 2:297160/142‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt > 1:297160/1‑142 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGACCTCAGGCTGCTATTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 1:1185250/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTACGACGATGCCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAAGCTGCTGTTTCGTCTGTGTCTGGCAGGGCt > 2:490728/1‑150 (MQ=38) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacga < 2:1530258/89‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacga > 1:1530258/1‑89 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCCGCGCtt > 2:279307/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:426830/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 1:2244845/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGAGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGGAGGAGCC‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:393838/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGctg > 2:2778187/1‑73 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGctg < 1:2778187/75‑3 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacgac < 1:1513057/89‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacgac > 2:1513057/1‑89 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGAAGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGAGCTTc > 1:1128007/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGAGGAAGAGGCAGCGGAAGG‑GCGTGGGTTACCCCAGTAATCACCTGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCGGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:764072/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 1:426830/150‑1 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGTTGTTCTTGTAGAAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCATCACGCCCTCAGGCTGCTTTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt < 2:764072/150‑1 (MQ=39) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 1:1962651/1‑70 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:1962651/70‑1 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:1384934/1‑150 (MQ=255) | TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |