New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1126598 = | 75 (1.510) | 15 (0.360) | 9/224 | 3.5 | 21.0% | intergenic (‑47/+103) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1126656 = | 50 (1.200) | intergenic (‑105/+45) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCA > NC_002947/1126522‑1126804 | cTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCg < 1:160587/150‑1 (MQ=255) gAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCa < 2:311189/150‑1 (MQ=255) aCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGAGCCCGCCAcc > 1:885951/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAAAGCCAGCCACCCa > 2:989194/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAg < 1:37724/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTGTACCCCCGAATTCGGAGGGATAGCCCACCTCCCCTTCGCGGGGAAAACCGCCCCTACACCACGCCCGCCCCCCaaa > 2:1214844/1‑149 (MQ=255) ccGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGc < 2:1187694/149‑1 (MQ=255) gAAGAGGTTCAGTGACATGTGTACCTCCTGCCAGGTGGTGGGGTGGACATTGAGCCCTGGAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTATACTCGCTCCTACACAGAGCCCTCCACCCAAGCCa < 2:885951/150‑1 (MQ=38) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATATCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt < 2:369114/150‑1 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt < 1:322267/145‑1 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt > 2:322267/1‑145 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCgg < 2:408102/150‑1 (MQ=255) cAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCggg < 1:538932/150‑1 (MQ=255) cAGCGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCggg < 1:48788/150‑1 (MQ=255) aCATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg < 2:1061641/150‑1 (MQ=255) aCATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg < 2:160559/150‑1 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATc < 1:1214844/150‑1 (MQ=255) ggACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCCGGTGGCGGGGAGGGCTATCa < 1:923804/150‑1 (MQ=255) cctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑c < 1:1174842/150‑1 (MQ=255) ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑Cg < 2:1000087/150‑1 (MQ=255) cctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTc < 1:104299/150‑1 (MQ=255) cacgttgttGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg < 2:826974/130‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg > 1:826974/1‑133 (MQ=255) aGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATa > 1:26847/1‑150 (MQ=255) ttgttgGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCCTCGCATTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAAGGGGCGGGGGGGGCTATCAGG‑GGTCCTGAtcccg > 1:1258825/1‑146 (MQ=37) gggTGGACATTGAGCCATGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCtcga < 2:292082/150‑1 (MQ=255) cTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAg > 1:814222/1‑115 (MQ=255) cTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAg < 2:814222/115‑1 (MQ=255) tGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGAt < 1:565798/124‑1 (MQ=255) tGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGAt > 2:565798/1‑124 (MQ=255) tAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCacac < 1:334652/150‑1 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGt > 1:989328/1‑150 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGt > 2:653825/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGAc > 2:408513/1‑121 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGAc < 1:408513/121‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGtt > 1:359696/1‑141 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGtt < 2:359696/141‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGcc > 1:159294/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGcc > 1:244460/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCg > 1:735150/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGa > 1:1005915/1‑150 (MQ=255) gAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACAACAGGTTGCGGTCGCCGAac > 1:529626/1‑150 (MQ=255) ggAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGAGCTATCAGGACG‑CCTGATAGcc > 2:215731/1‑100 (MQ=38) ggAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGAGCTATCAGG‑ACGCCTGATAGcc < 1:215731/101‑2 (MQ=37) ataGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAcc < 2:244460/150‑1 (MQ=255) ccaccaCCGCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAGCACGTTGTCGACCCGGc < 2:159294/150‑1 (MQ=255) caccaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGcc > 1:496462/1‑150 (MQ=255) cccaCCGCTTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAcccaacaa < 2:1258825/149‑6 (MQ=255) accaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTAACAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCg > 2:868842/1‑150 (MQ=255) tCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCCGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCACGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGcccagcg > 2:548759/1‑145 (MQ=255) gCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 2:26847/150‑1 (MQ=255) gCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc > 1:1139987/1‑150 (MQ=255) gCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCCACGGGCAGGCGCACAGCATGTTGCTGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 1:653825/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACGCGCTCCTAGACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCa < 2:1171233/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGc < 1:1037129/105‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGc > 2:1037129/1‑105 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCtt > 2:323182/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCtt > 2:290440/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTcc > 1:965333/1‑150 (MQ=255) cTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTcca < 1:989194/150‑1 (MQ=255) tCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGgc > 2:1248055/1‑81 (MQ=255) tCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGgc < 1:1248055/81‑1 (MQ=255) | CTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCA > NC_002947/1126522‑1126804 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |