New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1002378 = | 38 (1.630) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 8.8% | coding (612/1164 nt) | speC | ornithine decarboxylase |
? | NC_002947 | 1002468 = | 26 (1.160) | coding (522/1164 nt) | speC | ornithine decarboxylase |
AAGTCTTCCTTGAGGAAGCGGATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCG > NC_002947/1002229‑1002521 | aaGTCTTCCTTGAGGAAGCGGATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTaccttg > 1:324024/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGAAGCGGATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTgg < 1:153697/150‑1 (MQ=255) aaGGAAGCGGATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGCTCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGAt < 1:51450/149‑1 (MQ=255) aaGCGGATGAGTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATggcg < 2:232108/150‑1 (MQ=255) ggATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCGAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGt < 2:106055/150‑1 (MQ=255) caaggccgcaccgggctcgaaagtgtatgtgcgtattctgactgaaggctccaccactgccgactggccactgtcccgcaagttcggctgccagaccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCt < 1:169591‑M1/5‑1 (MQ=255) caaggccgcaccgggctcgaaagtgtatgtgcgtattctgactgaaggctccaccactgccgactggccactgtcccgcaagttcggctgccagaccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCt > 2:169591‑M1/131‑135 (MQ=255) gatgatTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTc > 1:478104/1‑150 (MQ=255) atgatTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTcc > 1:414434/1‑150 (MQ=255) ttcGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCt > 2:555667/1‑150 (MQ=255) ttcGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCt < 2:319497/150‑1 (MQ=255) tAGGTTTCCGGTCGTTTGGTTGGTGTGATGTAGTTGGCCGGTAAGCCGCCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTTTTTCAGACGTTCGAAGGTTACCTTGATCTTGGCGGTTGCGTCGTCCCACACGCTGATTTcg > 2:87271/1‑150 (MQ=255) aGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTcgc < 2:478104/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAg < 1:400801/150‑1 (MQ=255) ggTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCAc < 2:414434/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCGGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGaa > 2:397107/1‑150 (MQ=255) gTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTAACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAg > 2:154381/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGAt < 1:555667/150‑1 (MQ=255) gTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGAt < 1:253652/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCg > 1:566486/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGAGGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCg > 1:465517/1‑150 (MQ=255) gCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTAt < 2:566486/150‑1 (MQ=255) gCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTAt < 1:154381/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATgg < 2:425849/150‑1 (MQ=255) gggAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGc < 2:324024/150‑1 (MQ=255) accaccCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGcc < 1:111852/150‑1 (MQ=255) accaccCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGcc > 2:111852/1‑150 (MQ=255) gccactgtcccgcaagttcggctgccagaccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCa < 1:452788‑M1/86‑1 (MQ=255) accCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCGCCAGGCCCAg > 1:555482/1‑150 (MQ=255) cATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGCGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTc > 1:159/1‑150 (MQ=255) gTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTcgcg < 2:555482/150‑1 (MQ=255) ttGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAg < 1:174907/105‑1 (MQ=255) ttGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAg > 2:174907/1‑105 (MQ=255) cccgcaagttcggctgccagaccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCgg > 2:452788‑M1/57‑150 (MQ=255) tCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGa < 1:397107/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGa > 1:490288/1‑150 (MQ=255) cGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGt > 2:348078/1‑150 (MQ=255) ccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATg > 1:97068‑M1/36‑150 (MQ=255) ccGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATg > 1:189534/1‑150 (MQ=255) tCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCAt > 1:419898/1‑134 (MQ=255) tCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGACGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCag < 2:419898/134‑2 (MQ=255) ttACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTca < 2:409172/135‑2 (MQ=255) ttACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTca > 1:409172/1‑134 (MQ=255) tACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCg > 2:271906/1‑150 (MQ=255) | AAGTCTTCCTTGAGGAAGCGGATGATTTCTTCGGCGTAGGTTTCCAGGCTGTTGGTACGGGTGATGTAGTTGGCCGGGAAGCCACCACCCATGTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCG > NC_002947/1002229‑1002521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |