New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1573491 = | 26 (1.120) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 13.2% | coding (207/792 nt) | pcaD | 3‑oxoadipate enol‑lactonase |
? | NC_002947 | 1573532 = | 28 (1.260) | coding (248/792 nt) | pcaD | 3‑oxoadipate enol‑lactonase |
TGTCCAACTCGCTGGGTACCGACCTGGGCATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGACCCTGTGC > NC_002947/1573361‑1573638 | tGTCCAACTCGCTGGGTACCGACCTGGGCATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCcgcg > 2:352613/1‑150 (MQ=255) cggccgtgttgcacagggtcaggctgtgcaggcgctcacctgcatggatacccagccactggccgatcaggccgcccatcgacaggccgacgaattgagccttttgaatgtcccggcCATCGA‑‑‑GCTGTGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCt > 1:321493‑M1/118‑150 (MQ=255) ttgcacagggtcaggctgtgcaggcgctcacctgcatggatacccagccactggccgatcaggccgcccatcgacaggccgacgaagtgagccttttgaatgtccaggcCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATg > 1:382628‑M1/110‑150 (MQ=255) aCCTGGGCATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATg < 2:59781/150‑1 (MQ=255) cTGGGCATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGc > 2:166995/1‑150 (MQ=255) cATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGa > 1:121898/1‑150 (MQ=255) tcaggctgtgcaggcgctcacctgcatggatacccagccactggccgatcaggccgcccatcgacaggccgacgaagtgagccttttgaatgtccaggcCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATgg < 2:356461‑M1/42‑1 (MQ=255) tcaggctgtgcaggcgctcacctgcatggatacccagccactggccgatcaggccgcccatcgacaggccgacgaagtgagccttttgaatgtccaggcCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATgg > 1:356461‑M1/100‑141 (MQ=255) tgGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACAtt > 2:5515/1‑150 (MQ=255) ggACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCa < 1:5515/150‑1 (MQ=255) ccAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCaaaa > 1:23124/1‑147 (MQ=255) ccAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCaaaa < 2:23124/147‑1 (MQ=255) gCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTtcgc > 2:193081/1‑149 (MQ=255) ctGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCgg > 2:149456/1‑150 (MQ=255) cACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATg < 1:149456/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCCGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGACt < 1:352613/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTg > 2:166152/1‑150 (MQ=255) cccGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTgg < 1:166152/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCAc < 2:83064/106‑1 (MQ=255) ccGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCAc > 1:83064/1‑106 (MQ=255) cACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCAt > 1:218572/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGa < 2:121898/150‑1 (MQ=255) ggTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCt < 2:218572/150‑1 (MQ=255) gTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGAGACGTGCTGGATATGCTTGATGGCCTTGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTg > 1:168162/1‑150 (MQ=255) tCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGc > 1:492124/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGc > 1:29271/1‑56 (MQ=255) aaGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGc < 2:29271/56‑1 (MQ=255) gCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGa > 1:400249/1‑150 (MQ=255) ccTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGAcc > 2:610139/1‑150 (MQ=255) cTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGAccc > 1:366468/1‑150 (MQ=255) aGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTgg > 2:214671/1‑109 (MQ=255) aGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTgg < 1:214671/109‑1 (MQ=255) aGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGACCCTGTGc > 1:383816/1‑150 (MQ=255) | TGTCCAACTCGCTGGGTACCGACCTGGGCATGTGGGACACCCAGATTCCGCTCTGGAGTCAGCACTTCCGGGTGCTGCGCTATGACACCCGTGGTCACGGCGCATCGCTGGTCACTGAAGGCCCTTACAGCATCGAACAGCTGGGCCGCGACGTGCTGGCCCTGCTCGATGGCCTGGACATTCAAAAGGCTCACTTCGTCGGCCTGTCGATGGGCGGCCTGATCGGCCAGTGGCTGGGTATCCATGCAGGTGAGCGCCTGCACAGCCTGACCCTGTGC > NC_002947/1573361‑1573638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |