| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2357093 = | 15 (0.640) | 4 (0.190) | 4/234 | NT | 20.1% | coding (328/387 nt) | PP_2071 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2357165 = | 18 (0.840) | coding (256/387 nt) | PP_2071 | hypothetical protein | |||||
CATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTT > NC_002947/2356947‑2357230 | cATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGcc > 1:593035/1‑150 (MQ=255) cagttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGccc < 1:275805‑M1/5‑1 (MQ=255) aTGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGa > 1:532283/1‑150 (MQ=255) aaTTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTgcg > 1:478648/1‑150 (MQ=255) ggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggt < 1:153839‑M1/1‑1 (MQ=255) ggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggt > 2:153839‑M1/96‑96 (MQ=255) aGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGa > 1:149533/1‑150 (MQ=255) gacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGAcg < 1:445009‑M1/62‑1 (MQ=255) tACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGAcgccgc > 2:360761/1‑150 (MQ=255) agcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCcgcg > 2:445009‑M1/84‑150 (MQ=255) attcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGa > 1:217368‑M1/81‑140 (MQ=255) attcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGa < 2:217368‑M1/60‑1 (MQ=255) ggtgAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATag < 1:360761/150‑1 (MQ=255) ggtgAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATag < 2:593035/150‑1 (MQ=255) gtgAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATaga < 2:478648/150‑1 (MQ=255) aTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGc > 1:309903/1‑126 (MQ=255) aTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGc < 2:309903/126‑1 (MQ=255) ctctctGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCac > 2:598147/1‑149 (MQ=255) tctctGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGc > 1:258649/1‑150 (MQ=255) tcccttatgtgCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGc > 2:153901/8‑150 (MQ=255) gATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGt > 2:131553/1‑150 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATAc > 2:275805/1‑150 (MQ=255) cGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCtt > 1:530638/1‑150 (MQ=255) | CATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTT > NC_002947/2356947‑2357230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |