New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3622255 = | 36 (1.540) | 4 (0.190) | 4/230 | NT | 11.3% | intergenic (‑175/+51) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3622301 = | 30 (1.420) | intergenic (‑221/+5) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CTATGGTGGCCCTGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGC > NC_002947/3622110‑3622403 | gttcttctgcgcgatgcagaaggtcgcctgctgggcgccatcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGcc < 1:157505‑M1/4‑1 (MQ=255) ttctgcgcgatgcagaaggtcgcctgctgggcgccatcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTgg > 1:552830‑M1/143‑150 (MQ=255) tGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTcc > 2:229588/1‑150 (MQ=255) gagaATACGGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGc < 2:81942/150‑1 (MQ=255) tGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgtt > 2:516305/1‑150 (MQ=255) tGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgtt > 2:349879/1‑150 (MQ=255) ctgctgggcgccatcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatctccagccctgagccaaCGCCTTg > 1:545800‑M1/120‑126 (MQ=255) ctgctgggcgccatcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatctccagccctgagccaaCGCCTTg < 2:545800‑M1/7‑1 (MQ=255) aaGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTC‑CGTCGAGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGaa < 1:344616/150‑1 (MQ=255) gACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACa > 2:256365/1‑150 (MQ=255) gcgccatcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAgg > 2:26739‑M1/113‑150 (MQ=255) catcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCaa > 1:340675‑M1/109‑150 (MQ=255) catcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCaa < 2:340675‑M1/42‑1 (MQ=255) atcggcgtcagtggcgatacctcggacaacgatgagcggtgcgcgctgctggccatcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAg > 2:157505‑M1/108‑150 (MQ=255) gggTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTc < 1:339468/101‑1 (MQ=255) gggTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTc > 2:339468/1‑101 (MQ=255) tCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTc > 1:231674/1‑150 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAgg > 1:263086/1‑150 (MQ=255) gATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAggg < 2:218082/150‑1 (MQ=255) gATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAggg < 1:229588/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCAAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATc > 2:398098/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcg > 2:193295/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcgc < 1:478879/150‑1 (MQ=255) gCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGCCCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGTCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcgcc < 1:349879/150‑1 (MQ=255) gCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcgcc < 2:150088/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcgccg < 1:143095/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGc < 1:256365/150‑1 (MQ=255) tCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGc < 2:353322/127‑1 (MQ=255) tCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGc > 1:353322/1‑127 (MQ=255) cTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGc > 2:18666/1‑150 (MQ=255) tCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggt > 1:462321/1‑94 (MQ=255) tCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggt < 2:462321/94‑1 (MQ=255) agcagcATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGcc > 2:29762/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGa < 2:241667/127‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGa > 1:241667/1‑127 (MQ=255) ctccAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCt > 1:351992/1‑150 (MQ=255) gCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTg > 2:52085/1‑150 (MQ=255) agccGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGATCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCGCAGGGCTGAAGATCGACGCTGGCACCGATGAGCCCGAGCGCGTCGATGGCCGGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTc > 1:328890/3‑150 (MQ=255) cGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGa < 1:193295/150‑1 (MQ=255) cGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGa < 1:516305/150‑1 (MQ=255) cGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGa > 1:322806/1‑150 (MQ=255) gcagcaTGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg > 1:486872/1‑150 (MQ=255) gcagcaTGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 2:322806/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGAAGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATc < 1:466202/150‑1 (MQ=255) gCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCAc > 1:527842/1‑150 (MQ=255) gCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCAc > 2:358756/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGc > 1:517911/1‑150 (MQ=255) | CTATGGTGGCCCTGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCG‑GCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGC > NC_002947/3622110‑3622403 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |