New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6062179 | 25 (1.070) | 4 (0.180) | 4/248 | NT | 15.3% | coding (581/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
? | NC_002947 | = 6062220 | 20 (0.880) | coding (540/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
GTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACAC > NC_002947/6062032‑6062326 | gTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCa > 1:30000/1‑150 (MQ=255) aGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGGCCAGTGCGCCTCCAGGCCCTAAGTCACCTGCTGCTGACGGGGCAGCGCCCACGCCTGAACTAAGCGTACCCCCCGGCCCTCCGGCCCACCCTTCACAgcc > 1:249186/1‑150 (MQ=255) agggCCGAAACCACCAGGGCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGGGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCGGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCa < 2:249186/148‑1 (MQ=255) aTGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCa < 1:424239/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc < 2:361835/150‑1 (MQ=255) aaCCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGACCgg < 2:506539/150‑1 (MQ=255) caccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCAccc > 1:342624/1‑124 (MQ=255) caccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCAccc < 2:342624/124‑1 (MQ=255) ccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgca > 2:209335/1‑150 (MQ=255) ccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgca > 1:69249/1‑150 (MQ=255) tCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTTAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCcaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagg < 1:314699‑M1/150‑39 (MQ=255) gCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggc < 2:592600‑M1/150‑45 (MQ=255) gCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggc < 2:606519‑M2/150‑4 (MQ=255) tGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGtt < 2:69249/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGtt < 2:30000/150‑1 (MQ=255) ccGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGATTTACCTGCTGAAGACGGGTCAGTACCGGCCCCAGGTAGAAGCGTACACCCTGGCCCTCCACCCCACCCTGCACAGCCGCCGCACCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGGTca < 2:32748/150‑1 (MQ=255) gcgcCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctggagggcctgggtgtac < 2:379056‑M1/143‑63 (MQ=255) gcgcCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctggagggcctgggtgtac > 1:379056‑M1/1‑81 (MQ=255) tCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCacac < 1:52354/135‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCacac > 2:52354/1‑135 (MQ=255) ttGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCa < 2:354697/113‑1 (MQ=255) ttGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCa > 1:354697/1‑113 (MQ=255) tCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAgccgc > 1:506435/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGccc > 2:593790/1‑150 (MQ=255) tgctgcAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAGCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAgg < 2:444954/150‑1 (MQ=255) tgctgAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAgg < 1:327824/150‑1 (MQ=255) tgAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTc > 1:53851/1‑150 (MQ=255) gAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCa < 1:598466/150‑1 (MQ=255) aGACGGGTCAGCACCGGCCCCGGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATg < 1:606519/150‑1 (MQ=255) aCGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTc < 2:506435/150‑1 (MQ=255) gTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt > 2:514582/1‑150 (MQ=255) aGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCgg < 2:589885‑M2/67‑3 (MQ=255) aGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCgg > 1:589885‑M2/1‑65 (MQ=255) gTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgc < 2:379056‑M2/143‑82 (MQ=255) gTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgc > 1:379056‑M2/1‑62 (MQ=255) ccAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGa > 2:415573/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGa > 1:118801/1‑150 (MQ=255) gCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgc < 2:606519‑M1/150‑148 (MQ=255) gCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgc < 2:592600‑M2/150‑107 (MQ=255) ccgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctggagggcctgggtgtacgct < 2:589885‑M1/67‑66 (MQ=255) ccgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctggagggcctgggtgtacgct > 1:589885‑M1/1‑2 (MQ=255) | GTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACAC > NC_002947/6062032‑6062326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |