New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5743392 = | 26 (1.120) | 8 (0.380) | 8/228 | NT | 24.9% | intergenic (‑169/+78) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
? | NC_002947 | 5743446 = | 25 (1.200) | intergenic (‑223/+24) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
TGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGT > NC_002947/5743297‑5743585 | tgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCgg < 1:242891/150‑1 (MQ=255) aCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGt > 2:324467/1‑150 (MQ=255) ctctCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACg > 1:465731/1‑150 (MQ=255) cgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccattcgcgggcgcgctCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACg > 1:61225‑M1/81‑150 (MQ=255) gACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCGGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctca > 2:355557/1‑150 (MQ=255) aCGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcac < 2:293235/150‑1 (MQ=255) accattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgtgtccattcgcgggcgcgctCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctaacctca > 2:562151‑M1/70‑150 (MQ=255) cattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgctCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:539277‑M1/68‑128 (MQ=255) cattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgctCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:539277‑M1/61‑1 (MQ=255) aTAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATcc < 1:545376/150‑1 (MQ=255) gTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGCAGGGCGTCTTTGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCtt > 2:172712/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCa < 1:368408/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGACGGTGGAATGGTTGTGTGTCCTTTCGCGGGCGCGCTCGCTTCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCgg < 2:465731/150‑1 (MQ=39) ccAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa < 1:148587/129‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa > 2:148587/1‑129 (MQ=255) cTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATg < 1:123497/150‑1 (MQ=255) tgaggttaggccgttcgcgggcacgcccgctcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGt > 2:562151‑M2/82‑150 (MQ=255) gtgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTc < 1:355557/150‑1 (MQ=255) tgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGACTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTcc > 2:444410/1‑150 (MQ=255) ccATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac > 1:122652/1‑150 (MQ=255) cgttcgcgggcacgcccgctcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacg > 1:61225‑M2/71‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacg > 2:535144/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACgag > 2:503762/1‑150 (MQ=255) gcacgcccgctcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATg > 1:539277‑M2/62‑128 (MQ=255) gcacgcccgctcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATg < 2:539277‑M2/67‑1 (MQ=255) GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGCGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgt > 1:324467‑M1/1‑150 (MQ=255) tcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCGGccgtgc > 1:485894‑M2/52‑150 (MQ=255) ccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTcc > 2:63961‑M2/50‑125 (MQ=255) ccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTcc < 1:63961‑M2/76‑1 (MQ=255) CCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc < 2:144653‑M1/111‑1 (MQ=255) CCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc > 1:144653‑M1/1‑111 (MQ=255) cacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgccgt > 2:238108‑M2/49‑150 (MQ=255) AGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGtt > 1:503762‑M1/1‑150 (MQ=255) GTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc < 1:233914‑M1/54‑1 (MQ=255) GTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 2:233914‑M1/1‑54 (MQ=255) cgcAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCCTATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCATGCCGGGTTCGATACCg > 2:108824/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCTACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCg < 1:423341/144‑1 (MQ=255) ccTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCg > 2:423341/1‑144 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcga > 2:367588/1‑108 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcga < 1:367588/108‑1 (MQ=255) ttGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTgcgc > 1:183971/1‑150 (MQ=255) aggCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGccac < 1:495344/148‑1 (MQ=255) aaGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAACGATGCCCTCCGATGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGccac < 1:350456/150‑1 (MQ=255) aGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgcc > 2:221554/1‑125 (MQ=255) aGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgcc < 1:221554/125‑1 (MQ=255) gagaCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTg > 1:34623/1‑150 (MQ=255) acacCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCgg < 2:350900/150‑1 (MQ=255) tacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgt < 1:562151‑M2/136‑1 (MQ=255) cctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATTCCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtgt < 1:108824‑M2/138‑1 (MQ=255) tgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc < 2:426566‑M2/111‑1 (MQ=255) tgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc > 1:426566‑M2/11‑121 (MQ=255) tgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtgtgt < 2:122652‑M2/140‑1 (MQ=255) | TGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGT > NC_002947/5743297‑5743585 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |