Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_002947 | 1,852,190 | (GTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCG)1→2 | coding (1234/2241 nt) | relA → | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | 1852150 = | 12 (0.210) | 49 (0.940) | 40/240 | 0.4 | 82.9% | coding (1194/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
? | NC_002947 | = 1852182 | 9 (0.170) | coding (1226/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
CTTGGCGTATGCGCCCACTGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGATCAACGGCCGT > NC_002947/1852034‑1852327 | accgacgtcaagcccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTc < 1:826545‑M1/34‑1 (MQ=255) cgacgtcaagcccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgg < 2:1184108‑M1/36‑2 (MQ=255) gTATGCGCCCACTGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCACAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatc < 1:342329‑M2/150‑8 (MQ=255) aagcccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAg < 1:1458132‑M1/43‑1 (MQ=255) agcccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGc > 2:866854‑M1/107‑150 (MQ=255) agcccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGc > 1:149544‑M1/107‑150 (MQ=255) ccagctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCATGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTg < 2:851663‑M1/47‑1 (MQ=255) ccACTGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGGGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCTGAGCAGTTGTGGTTcgacatcggtggcct < 1:1060516‑M2/150‑16 (MQ=255) ccACTGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcct < 2:149544‑M2/150‑16 (MQ=255) agctccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGAc > 2:57555‑M1/102‑150 (MQ=255) tccaaccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCATGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCgg > 1:851663‑M1/99‑150 (MQ=255) tGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggcc > 2:911069‑M2/1‑131 (MQ=255) gcTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagc < 2:313812‑M2/150‑24 (MQ=255) ccactacgaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGTCCGGGTTTa < 2:629423‑M1/57‑1 (MQ=255) cAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagtt < 1:866854‑M2/150‑28 (MQ=255) ggCACCGACGGCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgg > 1:437241‑M2/1‑119 (MQ=255) ggCACCGACGCCAAGCCCACGTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGAGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgg > 2:164386‑M2/1‑119 (MQ=255) gaagaaaagatttcctggttgcgtcaggtgctggagtggcacgaagagctgggcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTc < 1:667964‑M1/64‑1 (MQ=255) 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aaGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctgg < 1:305406‑M2/124‑18 (MQ=255) aaGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctgg > 2:305406‑M2/1‑107 (MQ=255) aGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagc > 1:149544‑M2/1‑106 (MQ=255) aGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagc > 2:866854‑M2/1‑106 (MQ=255) tggttgagtcaggtgctggaaaggcacgaagggcggggcggcagcggtggcctggccgagcagttgcgggtCGACATCGGTGGCCTGGCCGACCAGTTGCGGGTCGCCATCGAGCCTCACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCAc < 2:1198317‑M1/79‑1 (MQ=255) ccAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcatggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctg < 2:851663‑M2/150‑48 (MQ=255) cAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcg > 1:688384‑M2/1‑102 (MQ=255) cAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcg < 2:688384‑M2/110‑9 (MQ=255) aGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgac > 2:57555‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcatggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgg > 1:851663‑M2/1‑98 (MQ=255) cAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcag < 1:1140404‑M2/121‑26 (MQ=255) cAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcag > 2:1140404‑M2/1‑96 (MQ=255) 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2:1272676‑M2/42‑23 (MQ=255) ctggccGAGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgag > 1:1272676‑M2/1‑20 (MQ=255) ctggccGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGcaca > 1:1331502/1‑121 (MQ=255) ctggccGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGcaca < 2:1331502/121‑1 (MQ=255) gccGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAg < 2:940999/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGAt < 1:313812/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGAt > 1:1265151/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGAt > 1:1114271/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgggtttatgt < 2:362545‑M2/73‑61 (MQ=255) aGCAGTTGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgggtttatgt > 1:362545‑M2/1‑13 (MQ=255) cAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGATCAAc < 1:1339174/150‑1 (MQ=255) ttGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgggtttatgtgttcacccccgacggccac > 2:1293647‑M2/1‑8 (MQ=255) ttGCGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgggtttatgtgttcacccccgacggccac < 1:1293647‑M2/87‑80 (MQ=255) tGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCATCCCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCCCGAAGATCAACGGcc < 2:826545/150‑1 (MQ=255) cGGGTcgacatcggtggcctggccgagcagttgcgggtcgacatcgagcctgaccgggtttatgtgttcacccccgacggccacgccatcgaccttcccaaaggcgccacgccattggacttcgcctaccgcgtgcacaccgagatcggc > 1:629423‑M2/1‑5 (MQ=255) | CTTGGCGTATGCGCCCACTGGCGCTACAAGGGCACCGACGTCAAGCCCAGCTCCAACCACTACGAAGAAAAGATTTCCTGGTTGCGTCAGGTGCTGGAGTGGCACGAAGAGCTGGGCGACATCGGTGGCCTGGCCGAGCAGTTGCGGGTCGACATCGAGCCTGACCGGGTTTATGTGTTCACCCCCGACGGCCACGCCATCGACCTGCCCAAAGGCGCCACGCCATTGGACTTCGCCTACCGCGTGCACACCGAGATCGGCCACAACTGCCGCGGCGCGAAGATCAACGGCCGT > NC_002947/1852034‑1852327 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |