New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5477138 = | 16 (0.280) | 13 (0.330) | 9/184 | 3.4 | 33.8% | intergenic (+3/+109) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 5477237 = | 40 (1.000) | intergenic (+102/+10) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
AGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCCAGCAGC > NC_002947/5476992‑5477283 | aGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCTGCATGCGTGGCGCTGCTGGCCTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGC < 2:1039066‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGC < 2:339168‑M1/150‑1 (MQ=255) ccctGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCC < 1:88685‑M1/149‑1 (MQ=255) ccTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCT > 1:567416‑M1/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCG > 1:651576‑M1/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGC < 1:489617‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCG > 1:367661‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCT < 2:494893‑M1/143‑1 (MQ=255) gCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCT > 1:494893‑M1/1‑143 (MQ=255) ccAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGG < 1:450017‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGG < 2:1450886‑M1/150‑1 (MQ=255) cagcagACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGG > 1:890883‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACC < 2:567416‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCT > 2:963015‑M1/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGC < 2:366923‑M1/146‑1 (MQ=255) cAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:366923‑M1/1‑146 (MQ=255) aGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:291921‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:904437‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCGGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa > 1:303209‑M1/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGc > 1:535460/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATc < 2:651576/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 1:232896‑M1/1‑136 (MQ=255) ggTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:232896‑M1/136‑1 (MQ=255) ggtggCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATc < 2:567367‑M2/150‑2 (MQ=255) ggtggCTGGTGTCGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTGCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTAGCAATATTGATGTTGCCTTTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATc > 2:149435‑M2/1‑149 (MQ=255) gtggCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGGTGGTCCGGTATACCTAGTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGGAAAACAGCTCCTACGC‑A‑‑CGTGAGCGCGCTCATcg < 1:1064591‑M2/150‑3 (MQ=255) gtTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCGGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgg < 2:303209‑M1/150‑29 (MQ=255) gtTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgg > 1:93832‑M2/1‑139 (MQ=255) gtTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgg > 1:567367‑M2/1‑139 (MQ=255) ttGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcggg > 2:986444‑M2/1‑138 (MQ=255) ttGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcggg > 2:1048071‑M2/1‑138 (MQ=255) ggCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCGTGGTTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttac < 1:860236‑M2/150‑18 (MQ=255) gctgctGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggc < 2:559464‑M2/150‑30 (MQ=255) tgctgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcggaggagcgggtttacccgcgaataggcag < 1:696110‑M2/150‑32 (MQ=255) tgctgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATAAGCGCGATCCCG‑TG‑gtaggagcgggtttacccgcgaataggccg > 1:821053‑M2/1‑120 (MQ=255) gctgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggccgg > 2:890883‑M2/1‑118 (MQ=255) gctgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggccgg > 2:535460‑M2/1‑118 (MQ=255) tgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgg > 2:172154‑M1/1‑99 (MQ=255) tgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgg < 1:172154‑M1/127‑29 (MQ=255) tgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > 2:67200‑M1/1‑96 (MQ=255) tgGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT < 1:67200‑M1/96‑1 (MQ=255) ggtTCTTCGCCATGCATGCGTGGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAATCCGCTCATACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggcgcgggtttacccgcgcatacgctggcacag > 2:1064591‑M2/2‑113 (MQ=255) gTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgc > 1:254792‑M1/1‑95 (MQ=255) gTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgc < 2:254792‑M1/113‑19 (MQ=255) atgcatgcGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGaa < 1:559464/150‑1 (MQ=255) atgcatgcGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGaa < 1:207189/150‑1 (MQ=255) tggCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATCTTCACGCTTCCGGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGc < 2:860236/148‑1 (MQ=37) ccGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGaa < 1:1246502/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGaa > 2:758119/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggccggcacagg > 2:1236075‑M2/1‑89 (MQ=255) cGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggccggcacagg < 1:1236075‑M2/127‑39 (MQ=255) gTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑Cgg < 2:237269/70‑1 (MQ=255) gTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑Cgg > 1:237269/1‑70 (MQ=255) tagTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTACACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCCTATCCTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCAGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTccccc < 1:1017350/148‑1 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgggt > 1:864993‑M1/1‑60 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgggt < 2:864993‑M1/90‑31 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGa > 2:969814/1‑150 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGAAGCGGGTTTACCCGCGCATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGa > 1:116494/1‑150 (MQ=255) tCAGGTATAAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcg < 2:1437894‑M2/87‑11 (MQ=255) tCAGGTATAAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcg > 1:1437894‑M2/1‑77 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc < 1:430747‑M2/89‑20 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc > 2:1297176‑M2/1‑70 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc < 1:1297176‑M2/89‑20 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc > 2:430747‑M2/1‑70 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgg > 1:203534‑M2/1‑70 (MQ=255) tCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgg < 2:203534‑M2/81‑12 (MQ=255) aaTATTGATATTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtagga > 2:1371600‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTATTGATATTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtagga < 1:1371600‑M1/75‑25 (MQ=255) atTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGGTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCCCTTGTCGTAAGATCGGGGTTACCCGCGGATAGGCCGGCACAGGCAGTACAGACCCATCAGGCGAACAGCTCCCCCTGAATGCGCTCcaaa > 2:704837/1‑148 (MQ=25) atTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCcagc < 1:969814/150‑1 (MQ=255) ttGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCcagca > 1:982976/1‑150 (MQ=255) gttGTTGCGTGTGCCGGCCGAGTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACGC‑A‑‑CGGGATAGCGCTTATCGTAGGAGCGGGATTACGCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACGCCCCCTGAATCCGCTCCagcagc < 2:980703/148‑1 (MQ=38) aTGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgg < 2:1377124‑M1/72‑29 (MQ=255) aTGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgg > 1:1377124‑M1/1‑44 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCcag > 2:665150/1‑142 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCcag < 1:665150/142‑1 (MQ=255) | AGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC‑A‑‑CGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCTGAATCCGCTCCAGCAGC > NC_002947/5476992‑5477283 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |