| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,273,093 | Δ1 bp | 6.1% | coding (192/1125 nt) | rlmG → | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,273,093 | 0 | A | . | 6.1% | 304.1 / 13.2 | 98 | coding (192/1125 nt) | rlmG | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/42); new base . (3/3); total (53/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGTGCTGG > NC_002947/5272944‑5273241 | cGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa < 2:1792982/150‑1 (MQ=255)cGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCACCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa > 2:1972569/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAg < 1:1050229/150‑1 (MQ=255) cccAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAg > 2:226209/2‑150 (MQ=255) ccAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAgg > 2:2067164/1‑150 (MQ=255) gCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCa < 1:2032010/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCa < 2:1132059/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCa < 1:2193515/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAg > 2:1800183/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACAAGCTTATACACCCGACGCCAATTGCCGTGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCa < 1:1971152/150‑1 (MQ=255) gCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAggtg > 1:451354/1‑150 (MQ=255) cGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGAGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCg < 1:982287/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGt < 1:734293/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCg > 1:1382113/1‑150 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTca > 2:292930/1‑134 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTca < 1:292930/134‑1 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCa > 1:832592/1‑150 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCa > 1:330555/1‑150 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCa > 1:1655969/1‑150 (MQ=255) cGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCt < 2:757295/150‑1 (MQ=255) cgacgaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTACAAT‑ACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCt < 1:1972569/150‑1 (MQ=255) gaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGcc > 1:138717/1‑150 (MQ=255) aGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGccc < 1:1085172/150‑1 (MQ=255) gTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCt > 2:2088192/1‑150 (MQ=255) tACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTg > 1:2026398/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAggg > 1:574237/1‑100 (MQ=38) ccTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAggg < 2:574237/102‑3 (MQ=38) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaa > 1:2349794/1‑150 (MQ=255) tGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa < 2:618373/92‑1 (MQ=255) tGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa > 1:618373/1‑92 (MQ=255) tGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaaa > 1:1387781/1‑150 (MQ=255) gCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCa < 2:1775682/102‑1 (MQ=255) gCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCa > 1:1775682/1‑102 (MQ=255) gCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTg > 2:75760/1‑130 (MQ=255) gCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTg < 1:75760/130‑1 (MQ=255) gcgcAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAAc < 2:1382113/150‑1 (MQ=255) cAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTCCA‑GCACGCTGGCAGGGGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTg < 2:324545/150‑1 (MQ=255) tACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAATCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgc > 1:1864712/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAAt > 1:770614/1‑150 (MQ=255) tCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCCGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATgg > 1:853692/1‑150 (MQ=255) cAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATCACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTCGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGc < 2:1412282/150‑1 (MQ=255) aGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTcagcag < 1:1158517/94‑1 (MQ=255) aGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTcagcag < 1:1158663/94‑1 (MQ=255) aGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTcagcag > 2:1158517/1‑94 (MQ=255) aGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTcagcag > 2:1158663/1‑94 (MQ=255) ggCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGAAAGCTAGGGATCCCCGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCt > 1:1003683/1‑150 (MQ=255) gCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCCGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTg > 1:161192/1‑150 (MQ=255) aCCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 2:453934/1‑150 (MQ=255) ccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaaaa > 2:490605/1‑124 (MQ=255) ccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaaaa < 1:490605/124‑1 (MQ=255) gCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCGGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGAc > 2:1552421/1‑150 (MQ=255) gCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGAc > 2:1932212/1‑150 (MQ=255) ccAAATGCCGCGTACTGGTGAT‑CAATGGCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGACCCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACa < 2:1098857/150‑1 (MQ=255) cAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAg > 2:545011/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCg < 1:129196/82‑1 (MQ=255) aaTTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCg > 2:129196/1‑82 (MQ=255) aaTTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAAAGGCCTGCCGTTCGACAgt > 1:1673470/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAgtgt < 1:1932212/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGtgtg < 2:161192/150‑1 (MQ=255) cGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCg > 1:524087/1‑150 (MQ=255) cGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAAAGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCg < 2:1673470/150‑1 (MQ=255) gggTACTGATGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGt > 1:2054616/1‑150 (MQ=255) ggTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGtt < 1:1800183/150‑1 (MQ=255) ggTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGtt < 2:2026398/150‑1 (MQ=255) gTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCCCCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc < 2:2170611/150‑1 (MQ=255) gTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc < 2:1003683/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTa < 1:545011/150‑1 (MQ=255) tGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCa > 2:167346/1‑79 (MQ=255) tGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCa < 1:167346/79‑1 (MQ=255) tGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc < 2:330933/146‑1 (MQ=255) tGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc > 1:330933/1‑146 (MQ=255) gTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCg > 2:87541/1‑75 (MQ=255) gCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGc > 2:1894141/1‑150 (MQ=255) cT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 2:1422528/1‑122 (MQ=255) cT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc < 1:1422528/122‑1 (MQ=255) t‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCa > 2:107881/1‑150 (MQ=255) cAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAg > 1:1030248/1‑150 (MQ=255) aaTGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGc > 1:628761/1‑150 (MQ=255) gACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGaa > 1:1184337/1‑150 (MQ=255) aCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACCGTGTGCCGGTCGTACCGGCCAGCGAac > 2:179193/1‑150 (MQ=255) aCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGATAGGACTGGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAac > 2:211077/1‑150 (MQ=255) gCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACt > 2:217866/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTg > 1:2408261/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTg < 1:903376/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCaa > 2:1776987/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAg < 1:505992/150‑1 (MQ=255) ccTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGccc < 2:1184337/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGTCAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCaa > 2:879233/1‑144 (MQ=255) cTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGTCAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCaa < 1:879233/144‑1 (MQ=255) tGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACa > 2:2321290/1‑108 (MQ=255) tGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACa < 1:2321290/108‑1 (MQ=255) tGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGt > 2:1223375/1‑150 (MQ=255) ggCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGtt < 1:453934/150‑1 (MQ=255) c‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGc < 2:2384934/110‑1 (MQ=255) c‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGc > 1:2384934/1‑110 (MQ=255) cAAGGCTTGC‑GGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCg > 2:1037831/1‑150 (MQ=255) cAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGAcc < 1:1679458/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGTGc < 1:2067164/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGTGc < 1:1720102/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGTGCTgg < 2:451354/150‑1 (MQ=255) | CGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCT‑CAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCT‑GCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGTGCTGG > NC_002947/5272944‑5273241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |