Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,039,899:1 | +G | 6.0% | coding (712/864 nt) | PP_3560 → | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,039,899 | 1 | . | G | 6.0% | 336.1 / 14.4 | 83 | coding (712/864 nt) | PP_3560 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (34/44); new base G (2/3); total (36/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
TTCGACAAGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGAAGC > NC_002947/4039758‑4040047 | ttCGACAAGCGTGCCTGGGGCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCg < 1:722670/150‑1 (MQ=255) gACAAGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCCGCCATggggat < 2:880471/150‑5 (MQ=255) gACAAGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGAt > 1:1533489/1‑150 (MQ=255) gACAAGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGAt < 1:1939857/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATgac > 1:713183/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATgac > 2:2024638/1‑150 (MQ=255) gTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGAcc < 2:621236/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGCAGAATCGTCA‑TTATGGGTCCCTGGCGCGCAGGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCt < 2:82012/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCCGCCATGG‑GGATgactgcca < 1:381398/147‑6 (MQ=255) cTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCCGCCATGG‑GGATgactgcca > 2:381398/1‑142 (MQ=255) tGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCaa > 1:1186779/1‑150 (MQ=255) cggccggcAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCtt < 1:2175787/150‑1 (MQ=255) cggcAGATCGAGCAGGAACGACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCa < 2:332098/150‑1 (MQ=255) tgcAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCAc > 2:582206/2‑150 (MQ=255) aTCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGcc > 1:1064221/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGcc > 1:852136/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGCTGACGGCCGACAACGCTACCCACCCCCCAcc > 2:1721064/1‑150 (MQ=255) gAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGTCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCAcctgcctg > 1:206728/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGt > 1:1811955/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGt > 1:619885/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGt > 1:765221/1‑150 (MQ=255) cgccgcCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGttt < 2:2041257/150‑1 (MQ=255) cgccgcCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGttg < 2:648817/150‑2 (MQ=255) gccgccAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTg < 1:699522/150‑1 (MQ=255) gccgacAGCAGGCGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTg > 2:1171476/1‑150 (MQ=255) gccAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGG‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCg < 1:2404700/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGa < 1:1372299/150‑1 (MQ=255) aggtgcaggtgAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGc > 2:1009670/1‑150 (MQ=255) gtgcaggtgAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCATGGCGCGCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAg > 2:563205/1‑150 (MQ=255) cGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCACAGCATCGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCcggcg < 1:145986/150‑1 (MQ=255) aCTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggt < 1:1029878/150‑1 (MQ=255) cTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtg < 2:1811955/150‑1 (MQ=255) cTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtg < 2:774754/150‑1 (MQ=255) cTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtg < 2:774780/150‑1 (MQ=255) tgctGGA‑ACTGGACAGCCCGGCTGGTCTGGCGCGCTTTGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtgg < 2:1839857/147‑1 (MQ=255) tGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtgg < 1:1093836/150‑1 (MQ=255) gATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtggt < 1:1526932/150‑1 (MQ=255) gATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtggt < 2:770209/150‑1 (MQ=255) aTGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTTGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGgtggtg < 2:1638728/150‑1 (MQ=255) aTGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGgtggtg > 1:498154/1‑150 (MQ=255) ggA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGtt > 1:1564283/1‑150 (MQ=255) a‑aCTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGc > 2:2156001/1‑150 (MQ=255) aCTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCt < 1:186017/150‑1 (MQ=255) gACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAg > 1:2177670/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCAt < 1:2024638/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGa < 2:1897622/144‑1 (MQ=255) ccAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGa > 1:1897622/1‑144 (MQ=255) ccAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGa > 1:35484/1‑150 (MQ=255) ccAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGa > 2:1033229/1‑150 (MQ=255) aaGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGaaaaaa < 1:1033229/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGATGTTGCTGGAGCATGaaaaaa < 1:1171476/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCa > 2:1324464/1‑49 (MQ=255) gCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCa < 1:1324464/49‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGc < 2:1962156/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCtt > 1:1738398/1‑72 (MQ=255) ccTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCtt < 2:1738398/72‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGGGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCa > 2:1342741/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAAGGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCCGGAAAAAAGACAg > 1:1101227/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAgc > 1:2224643/1‑150 (MQ=255) cgcgcATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAgcggc < 1:1041137/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAgcggcg < 1:1622946/150‑1 (MQ=255) cATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtggt > 1:31598/1‑117 (MQ=255) cATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGggtggt < 2:31598/117‑1 (MQ=255) gggCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCAtt < 1:1721064/149‑1 (MQ=255) cGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGa < 1:2005965/150‑1 (MQ=255) gTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGt > 1:1586289/1‑150 (MQ=255) aTGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCg < 2:1393625/150‑1 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ggtcgTCATCCGCCATGG‑GGATGACTACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTg > 2:1028557/5‑100 (MQ=38) aGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCt < 1:2156001/150‑1 (MQ=255) aTCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGaa < 2:35484/150‑1 (MQ=255) aTCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGaa > 1:671753/1‑150 (MQ=255) tCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGAAg > 2:1488826/1‑150 (MQ=255) cc‑ccATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGAAGc > 1:1421663/1‑150 (MQ=255) cc‑ccATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGAAGc > 1:1421697/1‑150 (MQ=255) | TTCGACAAGCGTGCCTGGGCCGGCCGGCAGATCGAGCAGGAACTACGCCGCCAGCAGGTGCAGGTGAGCGAACTGATGGA‑ACTGGACAGCCAGGAAGCCCTGGCGCGCATGGCGGTGATGGGCCTGGGCGTGGCAGTCATCC‑CCATGGCGGATGACGACCTGCAACGCTTGCCACCCGCCACCTGCCTGCCGTTTGGCGAGCCGCAGCTGACCCGGCGGGTGGTGTTGCTGGAGCATGAAAAAAGCCAGCGGCGGCATTTGAGTGCGGTGTTGAAGACCGCCCTGGAAGC > NC_002947/4039758‑4040047 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |