| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,797,387 | 1 | . | T | 12.7% | 333.3 / 50.4 | 102 | coding (46/777 nt) | lpxA | acyl‑[acyl‑carrier‑protein]‑‑UDP‑N‑ acetylglucosamine O‑acyltransferase |
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGT > NC_002947/1797241‑1797536 | ttCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑Tgg > 2:883420/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCGCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCACTATCGATCCGTCGGCC‑AGCTTGGCCGAc < 2:1252829/150‑1 (MQ=255) aGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACg > 1:592763/1‑150 (MQ=255) 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aaGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAg < 1:975043/150‑1 (MQ=255) aaGCATGATCTGGAAGTACGAGGCCCGCGCCTTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAg < 1:121248/150‑1 (MQ=255) gCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCACATGTCAATGGCAAGCCGGTATGATAGGCAGCAATCTCCTCCGAGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGt < 2:1706157/150‑1 (MQ=255) gATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGc > 1:1499854/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCC‑AGCTTGGCCGAc < 2:2441942/131‑1 (MQ=255) 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cGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCAGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCa < 2:1284568/150‑1 (MQ=255) gTCGGCC‑AGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTc > 1:1611273/1‑150 (MQ=255) gTCGGCC‑AGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTc > 1:2338453/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAAGC‑T‑GACGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTccc > 1:554002/1‑149 (MQ=255) gCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCg > 1:2146762/1‑150 (MQ=255) ccAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTGTCAGTTTTCCTCGa > 1:1074662/1‑150 (MQ=255) cAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCgg < 2:918135/63‑1 (MQ=255) cAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCgg > 1:918135/1‑63 (MQ=255) aaGC‑GGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGCCCCTGAGGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTAAAAGTCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATc < 1:1022218/150‑1 (MQ=255) c‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGt < 2:1039587/150‑1 (MQ=255) | TTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGT > NC_002947/1797241‑1797536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |