| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 196532 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 3/244 | NT | 12.0% | coding (2038/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 196574 = | 30 (0.320) | coding (2080/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/196680‑196532‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAACG > NC_002947/196574‑196724 CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 2:1782310/150‑1CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 2:1559640/150‑1CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTTAGGGTCGCGGTGGTG > 1:2174747/1‑150CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 1:831568/150‑1 CCTGGGTTTTGCCGGCGTCAACGGTAATCGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTCACCGGCGTCTGGGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCCCGCCGTAAGGGTCGCAGTGGTGG > 2:1222904/1‑150 CCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGG > 2:1364344/1‑150 CTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC > 2:1299946/1‑150 CTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC > 1:1784177/1‑150 CTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC < 1:48242/150‑1 CTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC > 1:1187583/1‑150 CTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC > 1:1187993/1‑150 ACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 1:846593/93‑1 ACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG > 2:846593/1‑93 TCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGG > 2:1570862/1‑87 TCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGG < 1:1570862/87‑1 AGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG > 1:306075/1‑79 AGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 2:306075/79‑1 CGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCA > 2:830259/1‑150 GCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTGATCACCTACACCGTGATCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTAACCGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAG > 1:1423112/1‑150 GCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTA > 1:1133488/1‑127 GCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTA < 2:1133488/127‑1 GCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG > 2:2316068/1‑46 GCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTG < 1:2316068/46‑1 GGTGAGCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGG < 2:1347282/38‑1 GGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGG > 1:1347282/1‑38 GGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAAC < 2:1145342/150‑1 GGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAAC < 1:830259/150‑1 GGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAAC > 1:1038473/1‑150 GGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAA > 2:1415435/1‑98 GGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAA < 1:1415435/98‑1 GCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGCCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAACG > 1:1738258/1‑150 GCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACG < 2:201934/69‑1 GCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACG > 1:201934/1‑69 GCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGCCCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAACG < 2:1652334/150‑1 CCCTGGGTCTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACTGTCACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/196680‑196532‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGTGACAGTGACCCTGTCCAACGGCCAAACCATTACCGTTGAAGCCGGCAAGACCCAGGGCAGCGTCGATTTCCAGACCCCGGCGAATGACGTCTACAACAACG > NC_002947/196574‑196724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |