New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 208935 | NA (NA) | 10 (0.110) | 6/240 | NT | 8.4% | coding (14441/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 210247 | 113 (1.210) | coding (15753/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
CACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTggtgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/208787‑208935 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGCGCAGCGTGG < NC_002947/210247‑210106 CACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTG > 1:1298707/1‑150 ACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGG < 2:559791/150‑1 CGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGT < 2:726059/150‑1 CGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGT < 2:652656/150‑1 CGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGT < 1:2030630/150‑1 CGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGT < 1:2170017/150‑1 CGCTGCGCAGCGCGATGACGTCTACAACGATGTTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCTACTGGTGCGACCTGCGAGAACCTCGATCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGT < 2:243392/150‑1 GCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACTCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTG < 1:907947/150‑1 GCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTG < 1:1060364/150‑1 GCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTG < 2:748508/150‑1 CTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCCGGATGGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGG < 1:1205518/150‑1 CTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGG < 1:1189906/150‑1 CTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGG < 2:1050356/150‑1 CGACACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTG > 1:1625892/1‑150 gatACCACCGACGAAGTGGTGGTATCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCGAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC > 2:1551056/4‑150 GACACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCTGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC > 2:897311/1‑150 GACACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCGGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC > 1:1429526/1‑150 GACACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC > 1:2031727/1‑150 atACCACCGACGAAGTGGTGGTATCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCGAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGCG > 1:693285/3‑150 ACACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGCG > 2:1651794/1‑150 CACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAG > 2:1408343/1‑41 CACCACCGACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAG < 1:1408343/41‑1 GACGAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGCGCAGCGTGG < 2:2031727/150‑1 GAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCAT < 1:853794/130‑1 GAAGTGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCAT > 2:853794/1‑130 TGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC < 2:1248067/131‑1 TGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGC > 1:1248067/1‑131 CACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTggtgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/208787‑208935 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAGCTCCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCCACCGCCGAGGTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCGTCGTTGTAAACGTCATCACCCTGCGCAGCGTGG < NC_002947/210247‑210106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |