| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 372622 = | 148 (1.590) | 9 (0.100) | 8/232 | NT | 6.2% | intergenic (+39/‑140) | dgcA/dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit/dimethylglycine dehydrogenase subunit |
| ? | NC_002947 | 372699 = | 135 (1.560) | intergenic (+116/‑63) | dgcA/dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit/dimethylglycine dehydrogenase subunit | |||||
GAAGGGTGTTCAACATGGGAGGCTCCCACAAACAGCTGGATTCTTGCGCCGACCAGAGGGCGAGACTGGCCCCATGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/372777‑372622‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGG > NC_002947/372699‑372845 GAAGGGTGTTCAACATGGGAGGCTCCCACAAACAGCTGGATTCTTGCGCCGACCAGAGGGCGAGACTGGCCCCATGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAAC > 2:1184383/1‑150 AAGGGTGTTCAACATGGGAGGCTCCCACAAACAGCTGGATTCTTGCGCCGACCAGAGGGCGAGACTGGCCCCATGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACC > 1:2352565/1‑150 AGGGTGTTCAACATGGGAGGCTCCCACAAACAGCTGGATTCTTGCGCCGACCAGAGGGCGAGACTGGCCCCATGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCC < 1:1031311/150‑1 TTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCT > 1:1312503/1‑150 CCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCC < 1:1098773/141‑1 CCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCC > 2:1098773/1‑141 CCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCA > 1:1157280/1‑108 CCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCA < 2:1157280/108‑1 GAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCT > 2:52647/1‑150 AATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTG > 1:2400319/1‑150 ATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGAAGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGC > 1:2299152/1‑150 TGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGG < 1:52647/150‑1 AAACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCG < 2:2400319/150‑1 ACCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCA < 1:1277273/150‑1 CCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCAT > 2:889851/1‑150 CCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCAT > 2:1446228/1‑150 CCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCAT < 1:305997/150‑1 CCCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCAT > 1:2059083/1‑150 CCCGCCCTTAAATGGGGCCAGTCTCGCCCTGTTGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGCACACCCGTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCTTGTGCGCAT < 1:1159986/150‑1 aCGCTCTTACATGGGGCCAGGCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATG > 2:1731687/2‑150 CCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATG > 2:1815909/1‑150 CCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATG > 2:1816689/1‑150 CCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGG > 1:381878/1‑118 CCGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGG < 2:381878/118‑1 CGCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGT < 2:2059083/150‑1 GCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTG > 1:982489/1‑150 GCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTC < 2:1010846/65‑1 GCTCTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTC > 1:1010846/1‑65 CTCTTACATGGTGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGATTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGTTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGG < 2:1258741/150‑1 GAAGGGTGTTCAACATGGGAGGCTCCCACAAACAGCTGGATTCTTGCGCCGACCAGAGGGCGAGACTGGCCCCATGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCCGGTCAGGCAACAGTGTTGTCAGTGCTGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/372777‑372622‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcTTACATGGGGCCAGTCTCGCCCTCTGGTCGGCGCAAGAATCCAGCTGTTTGTGGGAGCCTCCCATGTTGAACACCCTTCTACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGG > NC_002947/372699‑372845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |