New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1126598 = | 44 (0.470) | 18 (0.230) | 12/208 | NT | 31.4% | intergenic (‑47/+103) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1126656 = | 42 (0.540) | intergenic (‑105/+45) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
CAACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1126767‑1126598 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcattcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT > NC_002947/1126656‑1126796 CAACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCATGACGCCTGATAGGTCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCC < 1:1223009/150‑1 CGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 1:1858202/150‑1 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1282343/150‑1 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:1574561/150‑1 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:1447630/150‑1 GCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGG > 2:203299/1‑150 GCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAA > 2:1780385/1‑104 GCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAA < 1:1780385/104‑1 CTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGG > 2:528097/1‑78 CTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGG < 1:528097/78‑1 CTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1410394/77‑1 CTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:1410394/1‑77 TGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 2:2261818/67‑1 TGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:2261818/1‑67 TTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAG < 2:583969/102‑1 TTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAG > 1:583969/1‑102 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGC < 2:1238299/143‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC < 1:2325811/112‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC > 2:2325852/1‑112 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC > 2:2325811/1‑112 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC < 1:2325852/112‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGC < 2:584079/99‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGC < 1:815028/99‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGC > 1:584079/1‑99 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGC > 2:815028/1‑99 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCATACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGC > 1:1238299/1‑143 CGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC > 2:621484/1‑60 CGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC < 1:621484/60‑1 GCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGA > 2:1455974/1‑150 TGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACA > 2:510927/1‑45 TGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACA < 1:510927/45‑1 GCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCC < 1:1455974/150‑1 ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGG < 2:350588/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGC > 1:1352826/1‑150 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGC < 2:338290/150‑1 GGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGGTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTA > 1:1437320/1‑150 GTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCACCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACT > 2:2025878/1‑150 GTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGG > 2:973848/1‑101 GTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGG < 1:973848/101‑1 TAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT < 2:2430109/150‑1 TAAACCCGCTCAACAACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT < 1:2332147/150‑1 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG > 2:1048059/1‑55 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG < 1:1048059/55‑1 CAACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1126767‑1126598 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcattcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT > NC_002947/1126656‑1126796 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |