| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1126618 | 47 (0.500) | 7 (0.090) | 6/208 | NT | 14.7% | intergenic (‑67/+83) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1126634 | 42 (0.540) | intergenic (‑83/+67) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126452‑1126618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggtttacccgcgaatgcgATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCGGC < NC_002947/1126634‑1126486 GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:1428973/150‑1GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:2327309/150‑1 CCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGG < 2:983244/150‑1 CCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGG > 1:451340/1‑150 CTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTT > 1:1402999/1‑150 CTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTT > 2:717248/1‑150 CTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTT > 2:1984139/1‑150 CGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAC < 2:2081291/150‑1 AAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGCTGGACATTGAGCCCTGTAGGCCCGGGTCTACCCGC < 2:1275518/150‑1 GCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG < 1:1527509/150‑1 GCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG < 1:1677610/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGAGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:2445274/150‑1 GCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG > 1:752686/1‑135 GCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 2:752686/135‑1 GTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 2:2125007/113‑1 GTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC > 1:2125007/1‑113 GCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:1933116/62‑1 GCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:1942835/62‑1 GCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG > 2:1933116/1‑62 GCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG > 2:1942835/1‑62 CTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:340486/88‑1 CTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:340486/1‑88 GCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCT > 1:640616/1‑150 TTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAG < 1:1131011/93‑1 TTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAG > 2:1131011/1‑93 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 1:2152949/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 1:2074409/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 1:846726/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 1:717248/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCA < 1:758271/143‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCA > 2:758271/1‑143 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACC < 2:1874529/79‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACC > 1:1874529/1‑79 CGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCAC > 1:2020877/1‑150 GATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCGGC > 1:1651962/1‑150 GATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTG < 1:990579/108‑1 GATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTG > 2:990579/1‑108 GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126452‑1126618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggtttacccgcgaatgcgATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCGGC < NC_002947/1126634‑1126486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |