New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4386290 | 78 (0.840) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 6.3% | coding (163/501 nt) | PP_3862 | assembly protein |
? | NC_002947 | = 4386310 | 75 (0.840) | coding (143/501 nt) | PP_3862 | assembly protein |
TTTCCATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4386137‑4386290 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgcTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGCTC < NC_002947/4386310‑4386165 TTTCCATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGC > 1:1703126/1‑150 TTCCATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCACCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCC < 1:2061887/150‑1 CATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGGAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC < 2:494120/150‑1 CATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC < 2:2327222/150‑1 CATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC < 2:1703126/150‑1 CATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC > 2:165278/1‑150 CTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC‑‑CAAGGCGCCGAGGCCTTGGCG > 1:1468121/1‑150 AGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC‑‑CAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCT < 2:1468121/150‑1 cCCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGTAAACACCAGCACCACGCCTTGACTGCGTTCACCGATAAAGCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTAT < 1:886773/149‑1 TTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC < 2:433284/108‑1 TTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC > 1:433284/1‑108 GCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCG < 1:1980389/125‑1 GCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCG > 2:1980389/1‑125 GCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGTGTTGTGC < 2:524150/150‑1 GCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGC < 2:116395/150‑1 GCCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGC < 2:1013997/150‑1 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGCT > 2:1921792/1‑150 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGGTGTGCT > 2:1546392/1‑150 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAA > 1:459152/1‑112 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAA < 2:459152/112‑1 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTG > 2:1712148/1‑110 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTG < 1:1712148/110‑1 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGT > 2:1510375/1‑109 CCCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGT < 1:1510375/109‑1 CCGCTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGCTC > 1:266628/1‑150 TTTCCATCTCGATGAGCCGACCACGCTTGAGCACAACCCGGTCGCCTTCGTCGGTGTACAAGGCCACTTCACCGCCCTGCAGGCCGGGCAGGCGGTACCGCCGATCCGACACCACCAGCACCACGCCGTGACTGCGGTCACCGATAAAGCCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4386137‑4386290 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgcTTGAAGGCGCCGAGGCCTTGGCGGGCTTTATCGGTGACCGCAGTCACGGCGTGGTGCTGGTGGTGTCGGATCGGCGGTACCGCCTGCCCGGCCTGCAGGGCGGTGAAGTGGCCTTGTACACCGACGAAGGCGACCGGGTTGTGCTC < NC_002947/4386310‑4386165 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |