| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 295713 | 124 (1.330) | 19 (0.230) | 12/222 | NT | 13.2% | intergenic (+60/+82) | PP_0241/PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 295744 | 139 (1.680) | intergenic (+91/+51) | PP_0241/PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCTTG > NC_002947/295564‑295861 | accCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAG > 1:824463‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGt > 2:1999111/1‑150 (MQ=255) gatcaccccgcgcatggccgaggaaggcaagcgggtgttcgaagcgtatctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggctgctttgcaGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTc > 1:1099825‑M1/116‑150 (MQ=255) gggAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCt < 2:1551042/150‑1 (MQ=255) gggAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCt > 1:1737054/1‑150 (MQ=255) cTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAgg > 2:1993108/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAggg > 1:1856634/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTATATCACCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAggg > 2:463477/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCATTGTGCAGTCAAGTGTTTTTTTTATCGCCAAGCTGTGATTCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctgga > 1:1003973‑M1/1‑131 (MQ=255) ggccgaggaaggcaagcgggtgttcgaagcgtatctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggctgctttgcaGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAc > 1:937783‑M1/101‑133 (MQ=255) aGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGTTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCTCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTgc < 1:1772533/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTgcgcgc > 2:1385121/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGGGCAGCGAAGTGATTGCCCTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTgcgcgc > 2:2111310/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCggg < 2:243603/150‑1 (MQ=255) tGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtac < 2:747192‑M1/150‑32 (MQ=255) ggCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAATCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacct < 2:1255604‑M1/150‑34 (MQ=255) cAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgt > 1:949217‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgt > 2:488935‑M2/1‑146 (MQ=255) agtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCATCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTTCAGGCTCCACGCTGGCCctgtg < 2:1097788‑M2/150‑6 (MQ=255) ttgaagtgatTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgg > 1:209006‑M2/2‑144 (MQ=255) ttcgaagcgtatctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggccgcttggcgGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCgg > 1:1538410‑M1/79‑150 (MQ=255) tgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAGGCTGTGCTGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTCCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgg > 2:40140‑M2/1‑138 (MQ=255) aTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggc < 2:487266‑M2/150‑15 (MQ=255) ccTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc > 2:1713810/1‑150 (MQ=255) ccTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc < 1:1151130/150‑1 (MQ=255) cTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCCAGATCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGcc > 1:1310415/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGcc > 2:262925/1‑150 (MQ=255) tctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggccgcttggcgGCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGc < 1:1410828‑M1/70‑1 (MQ=255) tctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggccgcttggcgGCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGc > 2:1410828‑M1/68‑137 (MQ=255) gtgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGACTctgtgggagcgg < 2:2059816‑M2/139‑13 (MQ=255) gtgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGACTctgtgggagcgg > 1:2059816‑M2/1‑127 (MQ=255) aaGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAg < 1:763102/150‑1 (MQ=255) gggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatctggggccgcttggcgGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAgg > 1:1059233‑M1/64‑150 (MQ=255) tCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgc < 1:2178483/150‑1 (MQ=255) tCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCAAGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaa > 2:2452793‑M1/1‑90 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCTCTCCCACAGGTACTCGCAAACTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGACGCgccg > 1:1982359/1‑150 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgg < 1:989672‑M1/131‑44 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccg < 2:2233984/150‑1 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccg < 2:770215/150‑1 (MQ=255) aaGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAg > 2:237643/1‑150 (MQ=255) gtgtCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGATCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCg < 2:1577645/150‑1 (MQ=255) cTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCTTGGCGGccc < 2:692278/150‑1 (MQ=255) tATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGcccc > 1:54577/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGc < 1:1070752/139‑1 (MQ=255) ccAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGc > 2:1070752/1‑139 (MQ=255) ccAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAtt > 2:311787/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAtt < 2:828984/150‑1 (MQ=255) aaGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCCCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTtc > 2:576555/1‑150 (MQ=255) gCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAg < 2:2201243/134‑1 (MQ=255) gCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAg > 1:2201243/1‑134 (MQ=255) tGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGa < 1:487266/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGa > 2:608398/1‑150 (MQ=255) gcggcgGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGaa < 2:905725/150‑1 (MQ=255) tgagaaatctggggccgcttggcgGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAg < 1:2336599‑M1/69‑1 (MQ=255) gTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg < 1:2111310/150‑1 (MQ=255) gTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg < 1:2452061/150‑1 (MQ=255) cGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTGCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGcc < 2:2398768/150‑1 (MQ=255) tatTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCATGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgg < 2:1743376‑M1/90‑44 (MQ=255) tatTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCATGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgg > 1:1743376‑M1/1‑47 (MQ=255) tatTGGGGATGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGa > 1:240540/1‑150 (MQ=255) gggCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcgg < 2:1802595/150‑1 (MQ=255) gctgctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggcg < 2:986883/150‑1 (MQ=255) gctgctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggcg < 2:1198697/150‑1 (MQ=255) tgctTTGCCGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACggcggc < 2:1310415/150‑1 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcttgcccgcgaagggccgccaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttcgcgatagacac < 2:274188‑M2/150‑82 (MQ=255) gctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgg < 1:602146‑M2/74‑7 (MQ=255) gctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgg > 2:602146‑M2/1‑68 (MQ=255) gctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCa < 2:325575/150‑1 (MQ=255) gctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTATCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCa < 2:2034259/150‑1 (MQ=255) tttGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTct > 1:792080‑M2/1‑66 (MQ=255) tttGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCGCTGTGGTGACCGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATGTCTCAGCTGGAACGCCTGGCCAGAAACGGCGGCAGa > 2:2298110/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGATCGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATAc < 1:1243342/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATAc > 2:1020147/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACaa > 1:639826/1‑150 (MQ=255) CCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACTCTTGGCCAGAAAcgg < 1:1705570‑M1/136‑1 (MQ=255) CCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAAccc > 1:1510381‑M1/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcttgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgcctt < 2:186905‑M2/150‑94 (MQ=255) CTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCtt > 1:375108‑M1/1‑73 (MQ=255) CTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCtt < 2:375108‑M1/73‑1 (MQ=255) CTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAAcccc > 1:1020147‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcttgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcga < 1:2452793‑M2/146‑91 (MQ=255) TTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCa < 2:1059753‑M1/109‑1 (MQ=255) cccGATCACACATGTACTCGCAATCGCCATTGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTCCCCGTAAGAAGGCACCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGa < 1:1331784/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGc < 1:2391595/98‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGAGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGaa > 1:1634696/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcactt < 1:1068448‑M1/150‑142 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAacac < 1:262925/150‑1 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAacac < 1:311787/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgata > 1:2285767‑M2/1‑39 (MQ=255) tCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttgg < 2:419241‑M2/110‑72 (MQ=255) tCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttgg > 1:419241‑M2/1‑39 (MQ=255) ccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttcac < 1:1997882‑M2/150‑114 (MQ=255) cacaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGc < 1:982927/150‑1 (MQ=255) acaGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttcactg < 1:354595‑M1/150‑147 (MQ=255) acaGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaaggg < 1:298988‑M1/63‑60 (MQ=255) acaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCt > 2:1295400/1‑150 (MQ=255) caGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGAGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCtt < 2:1634696/150‑1 (MQ=255) caGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGAGCGGGCTATGTGGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCtt < 2:981624/150‑1 (MQ=255) agagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaa < 2:792080‑M1/68‑67 (MQ=255) aGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCTTg < 1:2175967/150‑1 (MQ=255) | ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCTTG > NC_002947/295564‑295861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |