New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 430723 | 126 (1.390) | coding (1594/1938 nt) | PP_0354 | CBS domain‑containing protein |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCTGGATGAAGTGGTAGGCCTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCT > NC_002947/430543‑430839 | gCTGGATGAAGTGGTAGGCCTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCGCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCG > 2:1147167‑M1/1‑150 (MQ=255) gATGAAGTGGTAGGCCTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAg < 1:1089376/150‑1 (MQ=255) aGTGGTAGGCCTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCt < 1:616571/150‑1 (MQ=255) 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ccTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGa < 1:729186/150‑1 (MQ=255) ctctTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAg > 1:2049900/1‑150 (MQ=255) ctctTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAg < 1:2015253/150‑1 (MQ=255) ctctTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCACAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTg > 2:2004137/1‑141 (MQ=255) ctctTCATAGGCGGAGCCGTACAACGGTTCGCTCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAg > 2:627137/1‑150 (MQ=255) 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cACGAAGGGCGTCGGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTc > 2:926694/1‑150 (MQ=255) cACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGc > 2:2211974/1‑123 (MQ=255) cACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTc < 1:238754/150‑1 (MQ=255) aCGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCg > 1:985871/1‑150 (MQ=255) cGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCgg < 1:1746341/150‑1 (MQ=255) gAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGc > 2:487114/1‑150 (MQ=255) gggCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCTGAcgcccttcgtggatggtgcccgtttgctggccctggccaatggcatagctgcctgcaataccctggagcgcctgcgccaactggtagccaagggcgtgatcgaaccgttggac > 1:1105149‑M2/1‑37 (MQ=255) gcggcgaccctcgacctcaaggtccagggcctgacgcccttcgtggatggtgcccgtttgctggccctggccaatggcatagctgcctgcaataccctggagcgcctgcgccaactggtagccaagggcgtgatcgaaccgttggacggc < 2:36363‑M1/150‑148 (MQ=255) gcggcgaccctcgacctcaaggtccagggcctgacgcccttcgtggatggtgcccgtttgctggccctggccaatggcatagctgcctgcaataccctggagcgcctgcgccaactggtagccaagggcgtgatcgaaccgttggacggc < 1:370812‑M1/150‑148 (MQ=255) gCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCcgcccttcgtggatggtgcccgtttgctggccctggccaatggcatagctgcctgcaataccctggagcgcctgcgccaactggtagccaagggcgtgatcgaaccgttggacggc < 1:233760‑M2/150‑117 (MQ=255) gCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGCTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCt > 2:2330103/1‑150 (MQ=255) | GCTGGATGAAGTGGTAGGCCTCTTCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCACGAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTC‑GCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCT > NC_002947/430543‑430839 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |