New junction evidence | |||||||||||
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GCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGC > NC_002947/834933‑835228 | gCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGt < 1:704057/150‑1 (MQ=255) ggAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGa < 2:2174441/150‑1 (MQ=255) ggAAGATACGCTTGAGATCGTCAAAGTCGAACAGCGCCAGGCCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACCGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGa > 2:1077020/1‑150 (MQ=255) gAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAg < 2:1037104/150‑1 (MQ=255) aTACGCTTTAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTgg < 1:1596591/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCt > 1:240621/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGa > 2:1292989/1‑139 (MQ=255) ttGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGa < 1:1292989/139‑1 (MQ=255) tCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccg > 2:1333807‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGctcgcagacccagctcaccggca < 1:1822877‑M1/150‑24 (MQ=255) aTTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGAAGCTGCCGGctcgcagacccagctcaccggcatcat < 1:270026‑M1/150‑28 (MQ=255) ttCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCGGTTAGGCAGGGGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTc > 2:490865/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGc > 2:1017807/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGcc > 2:1608260/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGcc > 1:1219454/1‑150 (MQ=255) ccccAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTgg > 1:2073057/1‑150 (MQ=255) cccAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTggg < 1:1363834/150‑1 (MQ=255) cccAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTggg > 2:496249/1‑150 (MQ=255) 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< 2:1461623/150‑1 (MQ=255) aGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAg > 2:1614073/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGccc < 1:1608260/150‑1 (MQ=255) tgctgcATCAGATTGGGCGCTATCAGGAGCAAGAGGGTTATCGCCTGGGCGCGTATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGAAGCTTCGGCCACTGGGTTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCCGAAACTGCCCCGAg < 2:479020/150‑1 (MQ=255) tgctgcAACAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAg < 2:986525/150‑1 (MQ=255) gctgcATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAgg < 2:2442344/150‑1 (MQ=255) 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ccGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGAc < 2:1749960/132‑1 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGAc > 1:1749960/1‑132 (MQ=255) ccAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGt < 1:2400426/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGtt > 2:257625/1‑150 (MQ=255) gcgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTAcc > 2:1433192/1‑150 (MQ=255) cgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCTCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTAccc < 1:430353/150‑1 (MQ=255) gatgatGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaat > 2:2305980‑M2/1‑28 (MQ=255) gatgatGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaat < 1:2305980‑M2/81‑54 (MQ=255) atgatgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcagcttcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggctgttcgaat < 1:270026‑M2/150‑124 (MQ=255) tgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGATCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGa < 1:1943885/150‑1 (MQ=255) tgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggctgttcgaatttgc < 1:1822877‑M2/150‑128 (MQ=255) tgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctg < 1:243593‑M2/64‑42 (MQ=255) tgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctg > 2:243593‑M2/1‑23 (MQ=255) tgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCAGATAGCTTCGTCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGa < 2:2133964/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAg < 1:154042/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAg < 1:655884/150‑1 (MQ=255) ccGGctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatct > 1:1598665‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGGctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatct < 2:1598665‑M1/76‑73 (MQ=255) cGGctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggctgttcgaatttgccga > 2:1333807‑M1/1‑3 (MQ=255) | GCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGC > NC_002947/834933‑835228 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |