New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1149525 = | 90 (0.960) | 11 (0.120) | 10/236 | NT | 11.2% | coding (235/513 nt) | PP_1008 | RNA polymerase subunit sigma‑24 |
? | NC_002947 | 1149552 = | 89 (1.010) | coding (208/513 nt) | PP_1008 | RNA polymerase subunit sigma‑24 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GATGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGCCGT > NC_002947/1149376‑1149672 | gATGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCAt > 2:1546139/1‑150 (MQ=255) aTGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATg > 1:1954584/1‑150 (MQ=255) tgcagcgcatggtcggtaaccccagcacggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGc < 2:2224620‑M1/3‑1 (MQ=255) tGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGc > 2:810442/1‑150 (MQ=255) tGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGc < 2:640542/150‑1 (MQ=255) gcagcgcatggtcggtaaccccagcacggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGCg < 1:2171622‑M1/4‑1 (MQ=255) aaaaTGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGt < 1:810442/150‑1 (MQ=255) aaTGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGc < 2:1577148/150‑1 (MQ=255) aaTGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGc < 2:912553/150‑1 (MQ=255) gttgttGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGt > 1:2087596/1‑143 (MQ=255) gttgttGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCa > 2:484836/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCAc < 2:216050/150‑1 (MQ=255) tcggtaaccccagcacggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccacaTTCGTGCCTGCAccc < 2:2096730‑M1/15‑1 (MQ=255) aaccccagcccggccgacgcccggctgtcggcaaccgtcctgcgtgtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctgcaccaccTGCGTGCCTGCACCCGGCGt > 2:1204315‑M1/131‑150 (MQ=255) gTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGTTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTg > 2:900817/1‑150 (MQ=255) tCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCACTATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCa < 1:2157916/150‑1 (MQ=255) cagcacggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGC‑‑‑‑CTGCACCCGGCGTGCACGCAgg > 2:1568276‑M1/126‑150 (MQ=255) tCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCa < 1:484836/150‑1 (MQ=255) gTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGc < 2:667066/131‑1 (MQ=255) gTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGc > 1:667066/1‑131 (MQ=255) ttgattgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCTGCGTGCACGccgggt < 1:2260219/150‑6 (MQ=255) ttgattgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAggtg < 1:976401/150‑1 (MQ=255) ggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAggtg > 2:975954‑M1/120‑150 (MQ=255) ggccgaagacctgctgcaggaaacctacctgcgggtgtcccgcgcgctgggcgagcggcccatcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccacaTTCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAggtg > 1:2096730‑M1/120‑150 (MQ=255) gagtgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAggtggt < 2:44587/147‑1 (MQ=255) ttgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTcc > 1:2224620/1‑150 (MQ=255) tgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCa < 1:1292224/150‑1 (MQ=255) gaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCAt > 1:1195283/1‑114 (MQ=255) aGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAgc > 1:1768368/1‑150 (MQ=255) aGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAgc > 1:1403040/1‑150 (MQ=255) cGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGt > 1:14480/1‑150 (MQ=255) cTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCAccc < 2:348456/118‑1 (MQ=255) cTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCAccc > 1:348456/1‑118 (MQ=255) tGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgc > 1:1000187/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgcgc < 1:2070718/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgcgc < 1:39002/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGAGCAAGTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgcgcgc < 1:913230/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGt > 1:774040/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTc > 1:1511700/1‑150 (MQ=255) gAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTg > 2:2171622/1‑150 (MQ=255) gCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGaa > 1:2295622/1‑150 (MQ=255) tCGNCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAAc > 2:1506182/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAacac > 1:1436610/1‑146 (MQ=255) tCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAacac < 2:1436610/146‑1 (MQ=255) cGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACg < 1:2088774/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGATGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACg > 2:1486747/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCCGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCAAGCGCCAGGTTGCGAGCGGTCTGAAACACGAACgg < 2:1281335/150‑1 (MQ=255) ggcggcATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGAt > 1:418936/1‑150 (MQ=255) ggcggcATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGAt < 1:900817/150‑1 (MQ=255) ggcggcATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGAt > 2:495701/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGaaa < 1:1725467/126‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGAt > 1:1108677/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATg < 2:2450052/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATg > 1:2450052/1‑150 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAg > 2:604888/1‑90 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAg < 1:604888/90‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCTGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATggg < 2:1279164/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGc > 2:1783770/1‑150 (MQ=255) catcgagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGC‑‑‑‑CTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAgc > 2:716818‑M1/60‑93 (MQ=255) gctggcGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCgcccgccc > 2:118858/1‑150 (MQ=255) gctggcGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGccc < 1:495701/150‑1 (MQ=255) ctggcGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCa < 1:1506182/150‑1 (MQ=255) tggcGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAg > 2:1061069/1‑150 (MQ=255) gcgACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCgg < 2:127015/150‑1 (MQ=255) gcgACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGACGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCgg < 2:1942024/150‑1 (MQ=255) cgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGc < 1:1664831‑M1/26‑1 (MQ=255) cgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGc > 2:1664831‑M1/43‑68 (MQ=255) gACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCgggg > 1:341955/1‑149 (MQ=255) gACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGa < 2:14480/150‑1 (MQ=255) cacTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAg < 2:480720/67‑1 (MQ=255) gtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccaccTGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCa > 1:2174835‑M1/38‑64 (MQ=255) tgtgCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCt < 1:673516/93‑1 (MQ=255) tgCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGc < 1:1888569/150‑1 (MQ=255) gcagcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCa < 2:1044107/60‑1 (MQ=255) gcagcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCa > 1:1044107/1‑60 (MQ=255) cagcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCag > 1:530591/1‑150 (MQ=255) agcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGcgcgcg > 2:583629/1‑137 (MQ=255) gcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGc > 2:481414/1‑110 (MQ=255) gcaCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGc < 1:481414/110‑1 (MQ=255) aCTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCaggtag < 2:1954584/150‑1 (MQ=255) gggCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGTTTTCCTg < 2:1000187/150‑1 (MQ=255) cgtcgtCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTgcagca < 2:1108677/150‑1 (MQ=255) tcgtcgACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCgg > 1:1564671/1‑120 (MQ=255) gtcgACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGcc > 1:890364/1‑52 (MQ=255) gtcgACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGcc < 2:890364/52‑1 (MQ=255) gtcgACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTc > 1:721416/1‑150 (MQ=255) aCCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCTCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCg < 1:513564/150‑1 (MQ=255) aCCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTgcagca < 2:779732/142‑1 (MQ=255) aCCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTgcagca > 1:779732/1‑142 (MQ=255) aCCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCtttg > 1:619671/1‑148 (MQ=255) ccAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCgg < 2:1768368/150‑1 (MQ=255) cAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGc < 2:2146553/101‑1 (MQ=255) aGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTgca > 2:2151234/1‑136 (MQ=255) aGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTgca < 1:2151234/136‑1 (MQ=255) aGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGcc < 2:2295622/150‑1 (MQ=255) aGCATGCATGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGTTTTTCGGcc < 1:2158666/150‑1 (MQ=255) gCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCaggt < 1:1657059/123‑1 (MQ=255) gCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCaggt > 2:1657059/1‑123 (MQ=255) gCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGCCg > 2:774382/1‑150 (MQ=255) cATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGCCGt < 1:1061069/150‑1 (MQ=255) | GATGAAAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGCACCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGCCGT > NC_002947/1149376‑1149672 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |