| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_002947 | 1,844,516 | Δ70 bp | 100% | coding (251‑320/2754 nt) | gacS ← | sensor protein GacS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1844515 | 1 (0.010) | 87 (0.960) | 65/244 | NT | 98.9% | coding (321/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
| ? | NC_002947 | 1844586 = | 1 (0.010) | coding (250/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGC > NC_002947/1844367‑1844664 | gCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGc < 1:1983533‑M1/150‑2 (MQ=255) cTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGACATCGGCCCGGACGGCGTAGTGGGCGATGTCGCGGGTTTTGCCGAACCCTCGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgcg > 1:1749804/1‑148 (MQ=255) tCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgc < 1:2030387‑M1/150‑4 (MQ=255) tCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgc > 2:70489‑M1/1‑147 (MQ=255) ccgATCTCTACCCAGCTACGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgc < 2:1945932‑M1/149‑4 (MQ=255) cGATCGCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcg > 2:149205‑M1/1‑146 (MQ=255) tctACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgc > 1:2361207‑M1/1‑141 (MQ=255) tctACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgc < 2:2361207‑M1/144‑4 (MQ=255) tACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatgg > 2:1875728‑M1/1‑139 (MQ=255) tACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcg > 1:1713710‑M1/1‑139 (MQ=255) cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggc > 1:369402‑M1/1‑137 (MQ=255) cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggc > 2:112297‑M1/1‑137 (MQ=255) ccagcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcc > 2:1139980‑M1/1‑136 (MQ=255) ccagcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcc < 1:1228724‑M1/150‑15 (MQ=255) agcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctg > 2:290275‑M1/1‑134 (MQ=255) gcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccag < 1:893398‑M1/150‑23 (MQ=255) gcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccag < 1:1791554‑M1/150‑23 (MQ=255) gcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccag < 2:1374259‑M1/150‑23 (MQ=255) 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gggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttg < 1:1360694‑M1/150‑98 (MQ=255) gggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttg < 1:986513‑M1/150‑98 (MQ=255) gggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccagggg < 2:223811‑M1/141‑89 (MQ=255) gggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccagggg > 1:223811‑M1/1‑53 (MQ=255) gTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgtt < 2:1471319‑M1/150‑100 (MQ=255) cgtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGTTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggc < 2:734403‑M1/150‑104 (MQ=255) gtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcg > 2:1767800‑M1/1‑46 (MQ=255) gtTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatc > 2:1613494‑M1/1‑43 (MQ=255) ttGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggaaagtctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatca > 1:287353‑M1/1‑42 (MQ=255) tGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgt < 1:1278425‑M1/133‑99 (MQ=255) tGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGagcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgt > 2:1278425‑M1/1‑35 (MQ=255) tGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgct > 2:783150‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggttttgccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgc > 1:258028‑M1/1‑28 (MQ=255) ggA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcag > 1:2098503‑M1/1‑26 (MQ=255) gTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccggg > 1:2055719‑M1/1‑23 (MQ=255) gTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccggg < 2:2055719‑M1/89‑67 (MQ=255) ttGGGTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagc > 2:2175207‑M1/1‑22 (MQ=255) ggTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgg < 2:1554327‑M1/150‑132 (MQ=255) ggTGCCGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgg < 2:385030‑M1/150‑132 (MQ=255) cGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccag < 2:736385‑M1/108‑95 (MQ=255) cGGTACCGCCGCTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccag > 1:736385‑M1/1‑14 (MQ=255) gccgcTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgggtgcgcaggtcg > 1:1519134‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgcTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgggtgcgcaggtcg > 1:1077317‑M1/1‑7 (MQ=255) gcTGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgggtgcgcaggtcgttc < 2:1519134‑M1/150‑147 (MQ=255) tGcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcgggaattgtctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgctagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgggtgcgcaggtcgttctg < 2:741207‑M1/150‑149 (MQ=255) gcgcgcacatcggcctgctccagggtttgtgcggcaattctctccagttgcgcaggcgcgagccgggccatggcgggtgcggccaggggcgccagttgttcggcgatcatcttgccgcgctgcagcagctgggtgcgcaggtcgttctgt < 2:1749804‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGC > NC_002947/1844367‑1844664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |