New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1868820 | 105 (1.130) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 5.7% | coding (892/1296 nt) | cobB | cobyrinate a,c‑diamide synthase |
? | NC_002947 | = 1868853 | 98 (1.080) | coding (925/1296 nt) | cobB | cobyrinate a,c‑diamide synthase |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GTTCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAACTGCTCGGCCTGCTGCCG > NC_002947/1868672‑1868969 | gTTCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCt < 2:72167/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCt < 2:519295/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTgg < 2:1487329/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTgg < 2:373277/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGAGCAAACTTGGTGCCCAGCTTGTGCTCTTCTCGCCTCTGCAGGAACCAC‑CACCGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCAGGCGCTgg > 1:2387277/1‑150 (MQ=255) tCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCa > 1:228928/1‑150 (MQ=255) aTCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAAc > 1:1414906/1‑150 (MQ=255) tCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACg > 1:867654/1‑150 (MQ=255) tCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACg > 2:2201141/1‑150 (MQ=255) cTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGc > 1:1723425/1‑150 (MQ=255) tATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATGCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCa > 2:1690663/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCAc < 1:1460546/150‑1 (MQ=255) ggCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCggatcgcctcgcacatc > 2:1900675‑M1/1‑133 (MQ=255) cTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAg > 1:786905/1‑150 (MQ=255) cTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAg < 2:1259843/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAg > 1:1091043/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGGACT‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCAGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAgg > 1:1023614/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAgg > 2:1967047/1‑150 (MQ=255) 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cccAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAgg < 1:578019/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCAcgcactcgg > 2:2361057/1‑144 (MQ=255) cAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGCACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGAtgtg < 2:1631703/119‑1 (MQ=255) cAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGAtgtg > 1:1631703/1‑119 (MQ=255) ttcttcTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTg > 2:1803119/1‑150 (MQ=255) tcttctCGCCGCTGCACG‑ACCACGACCTGCCGGCGGTCGACAGCATGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGc < 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tCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGc > 1:1907373/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCGGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTAGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTGCCTGCTCGATGCCCTAACGGACGTGGCCGGCGAACGTGcc > 2:1209150/1‑150 (MQ=255) tGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACGGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGa > 2:1280324/1‑150 (MQ=255) tGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAg > 1:919451/1‑91 (MQ=255) tGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAg < 2:919451/91‑1 (MQ=255) tGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGa > 1:1837595/1‑150 (MQ=255) gCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAACt < 2:4108/150‑1 (MQ=255) cATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTAc < 1:2113920/102‑1 (MQ=255) cATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTAc > 2:2113920/1‑102 (MQ=255) cACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCgcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggca > 1:1147411‑M2/1‑43 (MQ=255) aCCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCATGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAAc > 2:1236465/1‑141 (MQ=255) aCCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAAc < 1:1236465/141‑1 (MQ=255) aCCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAACTGCTCGGcc < 2:1643106/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAACTGCTCGGCct > 1:41295/1‑150 (MQ=255) cATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGGTGTGCGAGGCGATCCgcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggcagatacaggctgtctaccgccggcagttcgtggtcgtgctgcggcgagaagaacaccagctgggcacccaggttg < 2:32287‑M2/150‑111 (MQ=255) cATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCgcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggcagatacaggctgtctaccgccggcagttcgtggtcgtgcagcggcgagaagaacaccagctgggcacccaggttg < 2:792669‑M2/150‑111 (MQ=255) aTGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCgcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggcagatacaggctgtctaccgccggcagttcgtggtcgtgcagcggcgagaagaacaccagctgggcacccaggttgc < 1:1900675‑M2/150‑112 (MQ=255) gcggatcgcctcgcacatcggtgcgttggcggccagcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggcagatacaggctgtctaccgccggcagttcgtggtcgtgcagcggcgagaagaacaccagctgggcacccaggttgcgcaa > 1:2143745‑M1/1‑2 (MQ=255) cggatcgcctcgcacatcggtgcgttggcggccagcgcatggtgatgcagctcaggatatccacccggcagatacaggctgtctaccgccggcagttcgtggtcgtgcagcggcgagaagaacaccagctgggcacccaggttgcgcaac < 1:607800‑M1/150‑150 (MQ=255) | GTTCGCCTTCATCTATGGCGCTAACCTCGACCTGTTGCGCAACCTGGGTGCCCAGCTGGTGTTCTTCTCGCCGCTGCACG‑ACCACGAACTGCCGGCGGTAGACAGCCTGTATCTGCCGGGTGGATATCCTGAGCTGCATCACCATGCGCTGGCCGCCAACGCACCGATGTGCGAGGCGATCCGCGCCCACCACGCGCAGGGCAAGCCATTGCTGGCCGAGTGCGGCGGCATGCTGTACCTGCTCGATGCCCTGACTGACGTGGCCGGCGAACGTGCCGAACTGCTCGGCCTGCTGCCG > NC_002947/1868672‑1868969 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |