| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1919926 = | 86 (0.920) | 5 (0.050) | 4/244 | NT | 5.7% | coding (573/2115 nt) | prc | tail‑specific protease Prc |
| ? | NC_002947 | 1919969 = | 82 (0.900) | coding (530/2115 nt) | prc | tail‑specific protease Prc | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TAGTTGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTC > NC_002947/1919777‑1920072 | tAGTTGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGAtc > 2:2151254/1‑150 (MQ=255)tAGTTGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGAtc < 1:2151254/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGAtctt < 1:237712/150‑1 (MQ=255) 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gTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTc > 2:1552791/1‑150 (MQ=255) tAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCg > 2:480006/1‑150 (MQ=255) tAGGACGGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCg > 2:1912203/1‑150 (MQ=255) atgACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGt < 1:1215381/148‑1 (MQ=255) aCTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCtt < 1:480006/150‑1 (MQ=255) 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ttGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTg > 2:1332648/1‑150 (MQ=255) ccGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGGCGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTc < 1:611031/150‑1 (MQ=255) ccGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGAAGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTc > 1:563413/1‑150 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGttt > 1:804337/1‑110 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGttt < 2:804337/110‑1 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCTTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCGAGACCCTTGTTCAg > 1:710090/1‑150 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAg > 2:1667122/1‑150 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAg > 1:1080744/1‑150 (MQ=255) gCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGt > 1:799890/1‑124 (MQ=255) gCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGt < 2:799890/124‑1 (MQ=255) gATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTg > 1:360050/1‑142 (MQ=255) gATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTg < 2:360050/142‑1 (MQ=255) gATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTc > 2:1727013/1‑150 (MQ=255) | TAGTTGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGC‑GTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTC > NC_002947/1919777‑1920072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |