New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2516982 = | 96 (1.030) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 6.3% | coding (300/864 nt) | PP_2210 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2517002 = | 88 (1.000) | coding (320/864 nt) | PP_2210 | LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ACGGCGCGTGGAGCTGACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAA > NC_002947/2516838‑2517131 | aCGGCGCGTGGAGCTGACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCg < 2:379789/150‑1 (MQ=255) cGGCGCGTGGAGCTGACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCgg < 2:373088/150‑1 (MQ=255) cGGCGCGTGGAGCTGACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCgg < 2:281308/150‑1 (MQ=255) gCTCACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCACGCTTGAGGACAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCCGGTCATG‑‑CCGAt < 2:792305/150‑1 (MQ=255) gACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGAGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCGAGCTTCCGCCCCAATGACAGTTGCTTACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATAGGGTCTTT‑‑CCGGTGCt > 1:768332/1‑150 (MQ=255) cgcggctcgatttcggtcagcaccgccacgtcggcatgctcgccgagcagcgcagccaaggtctcctgagcattgcccaggcgcaagttgacggtgacaccagggtaccgctcacgcagcagcgcccGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTgg > 2:1770088‑M1/128‑150 (MQ=255) gggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCCTGCTTGAGGGTAACCTCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCgctgct > 1:1486203/1‑150 (MQ=255) gggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgcgc > 2:1554666/1‑146 (MQ=255) gggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgcgc < 1:1554666/146‑1 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgc > 2:1866125/1‑143 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgc < 1:1866125/143‑1 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGctgct‑g > 1:245602/1‑150 (MQ=255) gCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCTATCTGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGAAATCGGTCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCtgct‑gc < 1:191000/150‑1 (MQ=255) 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cgcCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGt < 2:2233987/150‑1 (MQ=255) gcCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTc > 2:1549546/1‑150 (MQ=255) cATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGc < 1:159765/128‑1 (MQ=255) cATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGc > 2:159765/1‑128 (MQ=255) cGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCATAAGTTCACCGTCAACTTgcg < 1:191408/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGt < 2:1419638/116‑1 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cTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTg > 1:749345/1‑150 (MQ=255) tGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGAAAAAATAACGCG‑GTCGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGc > 2:2433846/1‑150 (MQ=255) gTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGAcc > 2:941269/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGa > 2:1525383/1‑150 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTgg < 1:1226857/105‑1 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa > 2:196286/1‑150 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa < 2:354680/150‑1 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCACCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTCAGCGGTACCCTGGTGTCACCGCCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTgg > 2:1226857/1‑105 (MQ=255) cgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAAt > 2:650515/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCATGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 2:1891214/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 1:1226872/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 1:2216755/1‑150 (MQ=255) agcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg > 1:1043233‑M1/11‑92 (MQ=255) agcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg < 2:1043233‑M1/82‑1 (MQ=255) gcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCtt < 2:162456‑M1/90‑1 (MQ=255) gcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCtt > 1:162456‑M1/10‑99 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:340600/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:213412/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCCGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:24846/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCCCTCCGCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:24577/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCCCAGGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:24564/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAg < 2:2284358/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAg < 2:2216755/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCcg > 2:1236002/1‑150 (MQ=255) ccGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCg < 2:323022/118‑1 (MQ=255) ccGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCg > 1:323022/1‑118 (MQ=255) cGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCa < 2:315536/150‑1 (MQ=255) GCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCGGCGCaa < 1:1218047‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACGGCGCGTGGAGCTGACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCT‑GCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAA > NC_002947/2516838‑2517131 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |