New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2692342 = | 90 (0.960) | 5 (0.060) | 5/242 | NT | 5.5% | coding (460/534 nt) | PP_2359 | putative Type 1 pili subunit CsuA/B protein |
? | NC_002947 | 2692371 = | 86 (0.950) | coding (489/534 nt) | PP_2359 | putative Type 1 pili subunit CsuA/B protein |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGGTGGCACCCGTGCGCTCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACT > NC_002947/2692194‑2692491 | cGGTGGCACCCGTGCGCTCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATgg < 2:852486/150‑1 (MQ=255) gcgccgtcaccgtgaaggtactggtagtcactgcccccaaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgGGCa > 2:1134654‑M1/147‑150 (MQ=255) ccGTGCGCTCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGt > 2:427997/1‑150 (MQ=255) ccgtgaaggtactggtagtcactgcccccaaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgGGCa > 2:1122106‑M1/138‑141 (MQ=255) ccgtgaaggtactggtagtcactgcccccaaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgGGCa < 1:1122106‑M1/4‑1 (MQ=255) gcTCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTTGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCaa > 2:2179564/1‑150 (MQ=255) tCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTGTGGCAAGGCCGTCGGCAAGc > 2:2392076/1‑150 (MQ=255) tCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGc < 2:598381/150‑1 (MQ=255) tCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGACGACCAGTACCGGCGCAGCTCAGAGGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGc > 1:2232880/1‑150 (MQ=255) actggtagtcactgcccccaaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgGGCA‑GGCCGTCGGCAAGCCGGGc > 2:676541‑M1/128‑150 (MQ=255) gATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGc > 1:2404347/1‑150 (MQ=255) tGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGc > 1:846617/1‑150 (MQ=255) ggCATCTTTGTACCGTACGACCACTCTACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCCTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCa < 2:1191906/150‑1 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAgtg > 2:1412867/1‑148 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg > 2:347415/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg > 2:347754/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg < 2:2120033/150‑1 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg < 1:608282/150‑1 (MQ=255) cTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgt < 1:1596449/150‑1 (MQ=255) caaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgg > 2:577841‑M1/110‑110 (MQ=255) caaaggagcggccaacaacacgctgacgccagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgg < 1:577841‑M1/1‑1 (MQ=255) tACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACa > 2:1615703/1‑150 (MQ=255) aCCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAg > 1:1082981/1‑150 (MQ=255) cGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCTGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGacac > 2:342828/1‑150 (MQ=255) cGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAATCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGacac < 1:1953552/150‑1 (MQ=255) gACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCt > 1:305121/1‑125 (MQ=255) gACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGCCCCAACCGTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACg > 2:917671/1‑150 (MQ=255) ctATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGAtctc > 2:2048728/1‑150 (MQ=255) ccGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCg > 1:192946/1‑150 (MQ=255) cGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGa < 1:1634781/150‑1 (MQ=255) ggggCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTc < 2:807243/150‑1 (MQ=255) ggggCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTc < 2:185217/150‑1 (MQ=255) ggCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATg < 2:1854487/81‑1 (MQ=255) ggCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATg > 1:1854487/1‑81 (MQ=255) cagtcaggcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgcgGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgt < 1:481079‑M1/38‑1 (MQ=255) gTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCt > 1:1017187/1‑150 (MQ=255) tACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGc > 2:818211/1‑79 (MQ=255) tACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGc < 1:818211/79‑1 (MQ=255) tACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGc > 2:2049013/1‑79 (MQ=255) tACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTg > 1:267510/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGa < 1:2014724/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACAACCTCGGTCGCCCTGTCGTTCCGa < 2:1913217/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGAcc > 1:1256576/1‑150 (MQ=255) gcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgtgGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg < 2:1776286‑M1/36‑1 (MQ=255) gcctcctgccagccagccgcgcatgggtcagaacgacagctcgaccgagatcgtgtcgctgtacacccctgtgGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAggg > 1:1776286‑M1/74‑109 (MQ=255) gctgctGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTTAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCAt < 1:2366744/150‑1 (MQ=255) tgctgGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATgc > 1:261204/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATgc > 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aGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTc > 1:210229/1‑150 (MQ=255) ggTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCGGGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGAGTGTTGTTGGCCGCTCCttt > 1:2056569/1‑150 (MQ=255) ggTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCttt > 1:424058/1‑150 (MQ=255) gTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTg > 1:1187990/1‑150 (MQ=255) tCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg < 2:1082981/150‑1 (MQ=255) tCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg > 1:51483/1‑150 (MQ=255) tCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg < 2:2404347/150‑1 (MQ=255) tCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg > 2:221127/1‑150 (MQ=255) cAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTggg < 1:734283/150‑1 (MQ=255) cAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTggg < 1:1372296/150‑1 (MQ=255) cAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTggg < 1:307497/150‑1 (MQ=255) aCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCgt > 2:570362/1‑127 (MQ=255) aCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCgt < 1:570362/127‑1 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGctggctgg > 1:2129836/1‑100 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGctggctgg < 2:2129836/100‑1 (MQ=255) tttATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAg > 2:382585/1‑150 (MQ=255) ttATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGt < 1:1215160/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGAc < 1:1296026/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGAc > 1:1854431/1‑150 (MQ=255) GGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACt > 1:1259325‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCACAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGc < 1:823003‑M1/102‑1 (MQ=255) GGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCACAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGc > 2:823003‑M1/1‑102 (MQ=255) | CGGTGGCACCCGTGCGCTCGCCGATGGTTCTGGCAACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACT > NC_002947/2692194‑2692491 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |