New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2954675 | 43 (0.460) | 12 (0.140) | 8/228 | NT | 23.7% | intergenic (‑135/‑146) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2954738 | 38 (0.450) | intergenic (‑198/‑83) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
TTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGA > NC_002947/2954528‑2954824 | ttgttgtATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCg > 1:2299258/1‑150 (MQ=255) ttgttgtATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCg > 1:2299397/1‑150 (MQ=255) ttgtATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGaa < 1:1701916/150‑1 (MQ=255) ttgtATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGaa < 1:1404779/150‑1 (MQ=255) tATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGCCGAGCGGAAAGCTAGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCa > 2:1638325/1‑150 (MQ=255) ttGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCttt > 1:1146862/1‑150 (MQ=255) ttGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCttt < 2:2392859/150‑1 (MQ=255) tGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGTGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTg < 1:61273/150‑1 (MQ=255) tGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGCCAGGCGAGCGGGAGCAGCCTTC‑TCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTGGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTg < 2:1242222/150‑1 (MQ=255) cTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTggg < 1:657470/150‑1 (MQ=255) tAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTgggg < 1:405780/150‑1 (MQ=255) tAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCCACCAC‑A‑CCCTCCAGGCA‑CCCGCGAGCACCCTTTgggg > 2:624156/1‑150 (MQ=255) aCTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGG‑GGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCATGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGa < 2:972460/150‑1 (MQ=255) tCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAg > 2:542355/1‑150 (MQ=255) tCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTAACTC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTgggggggg > 1:501184/1‑146 (MQ=255) ccTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGc < 2:463545/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCAcc > 2:2048613/1‑136 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCAcc < 1:2048613/136‑1 (MQ=255) gAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGNGGa < 2:1506861/150‑1 (MQ=255) ggATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGCGCGGCCACAga > 2:982257/1‑149 (MQ=255) gATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCAc < 1:2084419/126‑1 (MQ=255) gATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCAc > 2:2084419/1‑126 (MQ=255) tGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCt < 1:417324/150‑1 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTg > 2:1652852/1‑127 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTg < 1:1652852/127‑1 (MQ=255) cccGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGTAGGTTGATCGGAAAGCTCGCAGCGCTTGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGc < 2:2094346/149‑1 (MQ=255) acCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATACTCCCAC‑GGCGCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgc > 2:1684331‑M1/1‑108 (MQ=255) cagcgGCAGGCGAGCAAGCGC‑GCTACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCt < 2:1958582/148‑1 (MQ=255) cgcgGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTggg < 1:1229269/122‑1 (MQ=255) cgcgGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTggg > 2:1229269/1‑122 (MQ=255) gcgGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcac < 1:140198‑M1/150‑47 (MQ=255) gCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATACTCCCACGG‑CGCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccc < 1:1684331‑M1/150‑49 (MQ=255) gAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAgg < 1:982257/150‑1 (MQ=255) ggcAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggt < 2:1122080‑M1/149‑57 (MQ=255) gCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGCACGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGt < 1:624156/150‑1 (MQ=255) cTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGCCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCATAAACCCGTCTCACCCCAAAGGGTGATTc < 1:1638325/150‑1 (MQ=255) cgACCGTCCGGTGTTGTGCCAGGAGGTCGAGCGGAACGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCggt > 2:501184‑M2/1‑147 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCggt > 2:1146862‑M2/1‑147 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaa > 2:1081779‑M1/1‑78 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaa < 1:1081779‑M1/130‑53 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTgg < 2:1439374/94‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTgg > 1:1439374/1‑94 (MQ=255) ggTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCACCCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcacc > 2:461371‑M1/1‑76 (MQ=255) ggTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCACCCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcacc < 1:461371‑M1/123‑48 (MQ=255) ttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTACCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCg > 1:1808349/1‑150 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaag > 1:1502528‑M1/1‑68 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaag < 2:1502528‑M1/121‑54 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTg < 1:1964875/149‑1 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTg > 2:1964875/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa < 2:1536241/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAgg < 1:297179/120‑1 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAgg > 2:297179/1‑120 (MQ=255) ggaggTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTa > 2:2046889/1‑150 (MQ=255) gaggTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTgac > 1:1329747/1‑99 (MQ=255) gaggTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGcc < 2:1329747/101‑1 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCtt > 1:467592/1‑94 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCtt < 2:467592/94‑1 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCACCCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctca < 2:1298328‑M1/102‑46 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCACCCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctca > 1:1298328‑M1/1‑57 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCg < 2:1299156‑M2/115‑2 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCg > 1:1299156‑M2/1‑114 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacga < 2:639324/150‑1 (MQ=255) c‑a‑cCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTCGCCCGGCTCACACCCTTTTTTGATTCGGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACgg < 1:542355/150‑1 (MQ=255) gCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACa > 2:406150/1‑150 (MQ=255) a‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagctttccgctcgacctccttgcacaacacctgacggtcg > 2:1146862‑M1/1‑3 (MQ=255) a‑CCggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagcgttccgctcgacctcctggcacaacaccggacggtcg > 2:501184‑M1/1‑3 (MQ=255) a‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGt < 2:1808349/150‑1 (MQ=255) cccGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTg > 1:1735194/1‑150 (MQ=255) cggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagctttc > 1:1299156‑M1/1‑1 (MQ=255) cggaatcaccctttggggtgagccgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagctttc < 2:1299156‑M1/115‑115 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:1933682/1‑150 (MQ=255) | TTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTC‑GCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAC‑A‑CCCTGCAGGCA‑CCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGA > NC_002947/2954528‑2954824 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |