| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3585378 = | 76 (0.810) | 4 (0.050) | 3/232 | NT | 5.7% | coding (348/762 nt) | benD | 1,6‑dihydroxycyclohexa‑2,4‑diene‑1‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 3585417 = | 61 (0.700) | coding (387/762 nt) | benD | 1,6‑dihydroxycyclohexa‑2,4‑diene‑1‑carboxylate dehydrogenase | |||||
GTCATGGCCAGCGCGGTGGAAACCCATGGCCGCCTGGACATCCTGGTCAACAACGTGGGCGGCACCATCTGGGCCAAGCCCTTCGAGCACTACGAAGTCGAGCAGATCGAGGCCGAGGTGCGCCGCTCGCTGTTCCCCACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTCGAAA > NC_002947/3585229‑3585526 | cgggcgcagtggcgttgacgcggatgccccggccggcggtttcgaaggccaggcaggcagtgagcgcgttgacgccacccttggctgcgccgtaaggcacacggttgacgccgcgggtagcgatggacgagacattgacgatggcgccac < 2:227671‑M1/1‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCGCGGTGGAAACCCATGGCCGCCTGGACATCCTGGTCAACAACGTGGGCGGCACCATCTGGGCCAAGCCCTTCGAGCACTACGAAGTCGAGCAGATCGAGGCCGAGGTGCGCCGCTCGCTGTTCCCCACCCTGTGGtgntgc < 2:1505271/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCGCGGTGGAAACCCATGGCCGCCTGGACATCCTGGACACGAAGCTCGTCGGCACCATCTGGGCCAAGCCCTTCGAGCACTACGAAGTCGAGCAGATCGAGGCCGAGGTGCGCCGCTCGCTGTTCCCCACCCTGTGGtgctgc < 2:664812/150‑1 (MQ=255) 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tCCCCACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCActgcct < 2:1710319/150‑1 (MQ=255) cccACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCActgcctgc > 2:2207015/1‑150 (MQ=255) cccACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCActgcctgc > 1:785999/1‑150 (MQ=255) cACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGtgtg > 1:1878537/1‑103 (MQ=255) cACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGtgtg < 2:1878537/103‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCt > 1:2145589/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGGGGCGGTCGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCt < 1:2091337/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCtt > 1:8920/1‑150 (MQ=255) tggtgCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTc < 2:6419/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTg > 2:547191/1‑116 (MQ=255) gtgCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTg < 1:547191/116‑1 (MQ=255) gtgCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTCGa > 2:490800/1‑150 (MQ=255) tgctgcCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTCGaa > 1:1013320/1‑150 (MQ=255) gctgcCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTCGaaa < 2:1845688/150‑1 (MQ=255) CTGCCACGCCGCGCTGCCATACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCgtgt > 2:597542‑M1/1‑90 (MQ=255) CTGCCACGCCGCGCTGCCATACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCgtgt < 1:597542‑M1/90‑1 (MQ=255) | GTCATGGCCAGCGCGGTGGAAACCCATGGCCGCCTGGACATCCTGGTCAACAACGTGGGCGGCACCATCTGGGCCAAGCCCTTCGAGCACTACGAAGTCGAGCAGATCGAGGCCGAGGTGCGCCGCTCGCTGTTCCCCACCCTGTGGTGCTGCCACGCCGCGCTGCCGTACATGCTCGAGCGTGGCAGTGGCGCCATCGTCAATGTCTCGTCCATCGCTACCCGCGGCGTCAACCGTGTGCCTTACGGCGCAGCCAAGGGTGGCGTCAACGCGCTCACTGCCTGCCTGGCCTTCGAAA > NC_002947/3585229‑3585526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |