| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3723717 = | 78 (0.840) | 9 (0.100) | 9/232 | NT | 11.4% | intergenic (+4/+26) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
| ? | NC_002947 | 3723739 = | 68 (0.790) | intergenic (+26/+4) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TGGATAACAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACC > NC_002947/3723568‑3723866 | acgcaatggctttcagtgcatggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaaga > 2:620065‑M1/150‑150 (MQ=255) cgcaatggctttcagtgcatggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaagAc > 2:39839‑M1/149‑150 (MQ=255) aTAACAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACaa < 1:1110490/150‑1 (MQ=255) tAACAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAg > 2:2047069/1‑150 (MQ=255) tAACAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAg < 1:1510129/150‑1 (MQ=255) aatggctttcagtgcatggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaagACAAg < 2:1863120‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAgg < 1:83416/150‑1 (MQ=255) cAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTCTGCATCGGTTGTCGAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGcc > 2:1300332/1‑150 (MQ=255) cAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGcc > 2:744655/1‑150 (MQ=255) atCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAgg < 2:503141/150‑1 (MQ=255) cGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGc < 2:354891/150‑1 (MQ=255) gACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGAGCCACACGCTCGTTTTATTCTATCTCTTCAGAGCGTTTGGTTCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGTTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGcc > 1:1863120/1‑150 (MQ=255) atggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaagACAAGGCCCGCAAGGGCCtt > 2:1529640‑M1/131‑150 (MQ=255) atggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaagACAAGGCCCGCAAGGGCCtt > 2:1531942‑M1/131‑150 (MQ=255) ggtctccagggacctggccagcaactacgcgatgcaccggctggtcaaggcactgggcttcacctcccgctaccccggcggcgatgtgagcgagattctgcacgaacttgacctgcggccttgaaaagACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGt > 2:2246883‑M1/129‑150 (MQ=255) cTGGTAGTGGGTAGTTATCAGCACCGTGGCATTGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTAATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGCGTTCTCCAGAGAGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGtgc < 2:632074/150‑3 (MQ=255) tCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGATGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTc < 2:2063067/150‑1 (MQ=255) aTGCGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCaa < 1:1853767/150‑1 (MQ=255) gggCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGc > 2:531458/1‑129 (MQ=255) gggCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGc < 1:531458/129‑1 (MQ=255) gggCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGCCTTTTCAAgg > 2:74266/1‑150 (MQ=255) gCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGcc > 1:1032903/1‑150 (MQ=255) gCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGcc > 1:2260464/1‑150 (MQ=255) cAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCg > 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gCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtct > 2:1152987/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtctc < 2:2135419/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCg < 1:1964172/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACaa < 1:888751/92‑1 (MQ=255) gTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCt > 2:873030/1‑150 (MQ=255) cgcgctCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCt > 1:1624968/6‑150 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> 1:282131/1‑150 (MQ=255) gCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGACCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATcgc > 1:1056823/1‑150 (MQ=255) cAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGCAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATcgcc < 1:2339731/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt > 2:1844054/1‑102 (MQ=255) aCTGCCGAGCGCGGTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt < 1:1844054/102‑1 (MQ=255) tGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTAGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCTCAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCggg > 2:1186899/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGCGCTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGt > 1:1788429/1‑150 (MQ=255) 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tGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTTATTTCCTCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg > 2:1978122/1‑150 (MQ=255) tGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg < 1:1056686/150‑1 (MQ=255) gaaaagACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGTAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATcgc < 2:2264593‑M1/122‑1 (MQ=255) gaaaagACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGTAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATcgc > 1:2264593‑M1/7‑128 (MQ=255) aaagACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGt < 1:1221604‑M1/115‑1 (MQ=255) aaagACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGt > 2:1221604‑M1/5‑119 (MQ=255) aaGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGga < 1:735765/150‑1 (MQ=255) cacaAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGCCCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAc > 2:179420/1‑150 (MQ=255) cacaAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAc > 2:1491137/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTGGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 1:2434671‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 2:227475‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 1:2434639‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGGATAACAATGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACC > NC_002947/3723568‑3723866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |