| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 3944242 | 104 (1.110) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 5.7% | coding (198/507 nt) | PP_5605 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3944252 | 103 (1.180) | coding (188/507 nt) | PP_5605 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
AGGTCGTCGCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGC > NC_002947/3944093‑3944391 | aGGTCGTCGCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGG < 2:1394298‑M1/150‑1 (MQ=255)aGGTCGTCGCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGG > 1:2097730‑M1/1‑150 (MQ=255) gtcgCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTcgcg > 1:1010226/1‑150 (MQ=255) tcgCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCgg < 2:829352/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCggg < 1:2085991/150‑1 (MQ=255) cgGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAg < 2:546076/150‑1 (MQ=255) tCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcc < 2:2215099‑M2/150‑3 (MQ=255) gcaccactgcggcaaATAAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGcctcccgcgacc > 2:98925‑M1/8‑138 (MQ=255) ccATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgtt < 1:1719786‑M2/150‑7 (MQ=255) cATGCGGCCGGTGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGcctcccgcgacctgttc < 2:66088‑M1/150‑18 (MQ=255) cATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgttc < 2:2203951‑M2/150‑8 (MQ=255) tGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCg < 2:1530955/150‑1 (MQ=255) cGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGcctcccgcgacctgttcccaa < 1:300707‑M1/150‑22 (MQ=255) aTGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAg > 1:1526990/1‑132 (MQ=255) aTGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAg < 2:1526990/132‑1 (MQ=255) gAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTcgc < 2:1365028/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCgg > 2:576360/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCgg < 1:1697567/150‑1 (MQ=255) cTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTcgc > 1:1948575/1‑122 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aTTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCg > 2:703848/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGt < 1:1103217/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTg < 1:1504457/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGc > 2:193229/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGtcgcgggaggcctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggc > 1:1871368‑M1/1‑15 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGtcgcgggaggcctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggc < 2:1871368‑M1/124‑110 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAAc < 1:797978/135‑1 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGcc < 2:2391261/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGcc > 2:1161573/1‑150 (MQ=255) gAACAGGcctcccgcgacctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggccccggaactgcctttccagttcatcggccgcatg < 2:2203951‑M1/150‑144 (MQ=255) aaCAGGcctcccgcgacctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggccccggaactgcctttccagttcatcggccgcatgg < 2:1794491‑M1/150‑145 (MQ=255) aaCAGGcctcccgcgacctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggccccggaactgcctttccagttcatcggccgcatgg < 1:1719786‑M1/150‑145 (MQ=255) aCAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTAGAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAgcg > 1:1126547/1‑150 (MQ=255) aCAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAgcg > 2:1042908/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGcgccgc > 2:1895367/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGcgccgc > 1:333692/1‑150 (MQ=255) | AGGTCGTCGCGGTCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGC > NC_002947/3944093‑3944391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |