New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4551237 | 84 (0.900) | 7 (0.080) | 6/236 | NT | 8.0% | coding (562/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
? | NC_002947 | = 4551255 | 82 (0.930) | coding (580/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGC > NC_002947/4551090‑4551384 | cACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACATACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCccgc > 2:1822892/1‑150 (MQ=255) tATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCccgcgccgc < 1:2211859/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGa < 1:948690/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGTAT‑CGAg < 2:2174859/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAg < 1:1230162/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgg > 1:1885380‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgggcc < 1:1926480‑M1/150‑24 (MQ=255) ggggCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGAt < 1:2154211/150‑1 (MQ=255) gcggcCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGcc > 1:660846/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGCCAGGTACCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCgtgt > 1:1276193/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTc > 2:228317/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGGTGCCGGAATGTGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGt < 2:379087/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGtt < 1:1286027/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGa > 2:752980/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATc > 2:1893891/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATc < 2:1811041/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCaa < 1:2334498/150‑1 (MQ=255) gtaccGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAac < 2:1276193/147‑1 (MQ=255) 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ccGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACt > 2:516513/1‑150 (MQ=255) gATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGc > 1:1359892/1‑150 (MQ=255) atactcGCCCGACGGCCCGCGCCGCGGAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCg < 2:136312/145‑1 (MQ=255) ccGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTc < 1:2177715/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCg > 2:1805179/1‑150 (MQ=255) cGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCg > 2:1679343/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCgg > 1:2087482/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCgg < 2:2087482/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCa < 1:1262839/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattccggcacctggccgacggccgcccccat < 1:1926480‑M2/150‑128 (MQ=255) ggCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtcgtc < 2:1176918/106‑1 (MQ=255) ggCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtcgtc > 1:1176918/1‑106 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgca > 1:1932554‑M2/1‑22 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgca < 2:1932554‑M2/83‑62 (MQ=255) cccccgcctcgatgcgcggcgcgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattccggcacctggccgacggccgcccccatg > 2:1265154‑M1/2‑4 (MQ=255) ccgcgccgcgCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattcc > 1:2041973‑M2/1‑20 (MQ=255) ccgcgccgcgCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattcc < 2:2041973‑M2/121‑102 (MQ=255) cccgcctcgatgcgcggcgcgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattccggcacctggccgacggccgcccccatgcc > 1:1885380‑M1/1‑2 (MQ=255) | CACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGC > NC_002947/4551090‑4551384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |