New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 4587342 = | 104 (1.190) | coding (519/1683 nt) | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CACCCACCATGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGCTCCT > NC_002947/4587158‑4587451 | tgaagccttcaagacgtctgattaccacaccatggtgcaggagctggtgcctgaactggccagtgccgcgcctggtgagctggccagtgaatgcctgcccgagttgcggggcgtcatcagcctggccgccaacccgcctgccggcttcct < 2:1462521‑M1/2‑1 (MQ=255) cccaccATGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTctgc < 2:1876327/150‑1 (MQ=255) ccaccaTGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTctgcc > 1:588568/1‑150 (MQ=255) ccaccaTGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTctgcc < 2:588568/150‑1 (MQ=255) gccttcaagacgtctgattaccacaccatggtgcaggagctggtgcctgaactggccagtgccgcgcctggtgagctggccagtgaatgcctgcccgagttgcgtggcgtcatcagcctggccgccaacccgcctgccggcttcctgccc < 1:1860649‑M1/6‑1 (MQ=255) ccttcaagacgtctgattaccacaccatggtgcaggagctggtgcctgaactggccagtgccgcgcctggtgagctggccagtgaatgcctgcccgagttgcgtggcgtcatcagcctggccgccaacccgcctgccggcttcctgccct > 2:668123‑M1/144‑150 (MQ=255) accaTGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTctgccct > 1:1584222/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCt > 1:652706/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACGGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCg > 2:1332856/1‑150 (MQ=255) ttgAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAAt < 1:2229247/150‑1 (MQ=255) aGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCg > 1:633387/1‑150 (MQ=255) ggATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGt > 2:1370943/1‑150 (MQ=255) gATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTg > 1:1033401/1‑150 (MQ=255) 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gggCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCAtt > 2:2225055/1‑120 (MQ=255) cTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCa < 2:2126745/150‑1 (MQ=255) tgCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGtt < 1:639460/150‑1 (MQ=255) cAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCa < 2:1977777/150‑1 (MQ=255) gCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAACTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGc > 1:1045823/1‑150 (MQ=255) ccTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGggca < 1:2233166/102‑1 (MQ=255) ccTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGggca > 2:2233166/1‑102 (MQ=255) cTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGc < 1:1754937/77‑1 (MQ=255) cTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGc > 2:1754937/1‑77 (MQ=255) gACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGggcag < 1:1170945/99‑1 (MQ=255) aCAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGc > 2:1099211/1‑150 (MQ=255) aGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGCTc > 2:2329745/1‑150 (MQ=255) aGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGCTc > 1:713702/1‑150 (MQ=255) aGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGAAGCGATTTCACAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCCGCTAACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGCTc > 1:1615105/1‑150 (MQ=255) aCGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCa > 1:2001915/1‑141 (MQ=255) aCGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGACATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGAAATGGCCAGTTCAGACACCAGCTCCt > 1:1696721/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGgcg > 2:294047/1‑118 (MQ=255) | CACCCACCATGAAACCGTTGTTGAGGATGTTGTAGTGACTGAGCGTGGCACCTTTGGGTGCACCGGTGGTGCCGGAGGTGTACTGGATGTTTACCGGCTGGTCGAATTGCAGGCTTTGCTGACGGGCTGTGCAGGCCTCGACAGACGTCTGCCCTGCCCGCTCGGCAAATGCGTGCCAGGGCAGGAAGCCGGCAGGCGGGTTGGCGGCCAGGCTGATGACGCCACGCAACTCGGGCAGGCATTCACTGGCCAGCTCACCAGGCGCGGCACTGGCCAGTTCAGGCACCAGCTCCT > NC_002947/4587158‑4587451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |