| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4755172 = | 85 (0.910) | 8 (0.090) | 5/232 | NT | 9.3% | coding (368/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 4755215 = | 78 (0.900) | coding (411/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAAC > NC_002947/4755023‑4755321 | ccatcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgg > 2:1060576‑M1/150‑150 (MQ=255)cGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACg < 2:2115978/150‑1 (MQ=255) catcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGc < 1:689360‑M1/2‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGcc < 2:249288/150‑1 (MQ=255) atcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGcc < 1:1595243‑M1/3‑1 (MQ=255) tcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCa < 1:601560‑M1/4‑1 (MQ=255) tcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCa < 2:891804‑M1/4‑1 (MQ=255) tcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCa < 1:1436718‑M1/4‑1 (MQ=255) cacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAg > 1:2178842‑M1/146‑150 (MQ=255) cGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGc < 2:72071/150‑1 (MQ=255) tcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggccggctacacagagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGccc < 1:2253344‑M1/9‑1 (MQ=255) tcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGccc < 2:935300‑M1/9‑1 (MQ=255) gACAGCGACGAACTGGCCCGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGcc < 2:32388/150‑1 (MQ=255) gacgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGcc < 2:118273/150‑1 (MQ=255) tggcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCg < 2:2407191/150‑1 (MQ=255) gcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCa > 2:1401331/1‑125 (MQ=255) gcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCa < 1:1401331/125‑1 (MQ=255) gcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgc < 2:716241/150‑1 (MQ=255) ctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgccg > 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tggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCcgcctgggcctt > 1:1275002‑M1/110‑149 (MQ=255) tggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctg > 2:74823‑M1/110‑150 (MQ=255) cgcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctg < 1:271602/150‑1 (MQ=255) gcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctgg < 2:189069/150‑1 (MQ=255) gttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgccgcctgggcctcgc > 2:820309‑M1/108‑147 (MQ=255) 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ccAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgc > 2:1394806/1‑115 (MQ=255) ccAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgc < 1:1394806/115‑1 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGc > 1:2087834/1‑150 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCACACCGCCAACCGTCCGc > 2:1896376/1‑150 (MQ=255) caccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggcaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCC‑‑‑‑‑AGCGCCCTGCTCGGCCgcctgg > 2:1441843‑M1/83‑113 (MQ=255) cTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCa > 2:921029/1‑150 (MQ=255) 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cagccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTg < 2:936552/138‑1 (MQ=255) cagccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtga < 1:971750/150‑1 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat < 1:504324/150‑1 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCACCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat > 2:1250924/1‑150 (MQ=255) aTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAAc < 2:559318/150‑1 (MQ=255) aTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAAc > 2:601560/1‑150 (MQ=255) aTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAAc < 2:1120191/150‑1 (MQ=255) cTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACgg < 2:1619387/150‑1 (MQ=255) tACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGt > 1:2037937/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTg < 1:141382/150‑1 (MQ=255) ccGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCGGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGcc > 2:1595243/1‑150 (MQ=255) ccccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcatca > 1:1285423/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtctc < 1:974575/113‑1 (MQ=255) ccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACatcatc < 1:2408885/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACatcatc > 1:790313/1‑150 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTg < 2:1285423/150‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTg < 2:800065/150‑1 (MQ=255) cgccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGc < 1:615705/150‑1 (MQ=255) ccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGACCCGCTTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcg > 1:1730145/1‑150 (MQ=255) cgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcga < 1:2296396/150‑1 (MQ=255) GCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaac < 2:474076‑M1/150‑1 (MQ=255) | CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAAC > NC_002947/4755023‑4755321 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |