New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5201627 = | 11 (0.120) | 15 (0.230) | 9/176 | NT | 59.1% | intergenic (‑65/‑115) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
? | NC_002947 | 5201722 = | 13 (0.200) | intergenic (‑160/‑20) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG > NC_002947/5201480‑5201708 | cttcctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgtgggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTg < 2:2066594‑M1/3‑1 (MQ=255) tgggcttCAAGCTCACCGGCAGGCACCCTACGGCGGCTATTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGC < 1:1204213‑M1/147‑1 (MQ=255) aGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTTCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCT < 1:724891‑M1/150‑1 (MQ=255) tggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCtgt < 1:1653727‑M1/8‑1 (MQ=255) aggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCg < 2:2097481‑M1/12‑1 (MQ=255) aaGCCCCCAAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTATCGTAGTTTTCGGTCAGGGTGTTCGTTCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAAGACTTCTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCG < 1:169205‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGc < 1:290849‑M1/14‑1 (MQ=255) gcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGc < 2:404903‑M1/14‑1 (MQ=255) gCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGC < 2:1582337‑M1/150‑1 (MQ=255) caccaGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTC > 1:1643125‑M1/1‑150 (MQ=255) caccaGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTC > 2:1629466‑M1/1‑150 (MQ=255) cagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcg > 1:1545842‑M1/130‑150 (MQ=255) agcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCG < 1:596834‑M1/150‑1 (MQ=255) cttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttgtcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGCGCCGGCCTCTTCGCgg > 2:1227443‑M1/127‑150 (MQ=255) cttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:2316541‑M1/24‑1 (MQ=255) agGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGG < 2:2403834‑M1/150‑1 (MQ=255) ttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGc < 2:1650826‑M1/10‑1 (MQ=255) ttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGc > 1:1650826‑M1/126‑135 (MQ=255) ggCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCATATGGTATACGCTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGG > 1:535061‑M1/1‑150 (MQ=255) ggtaatcgagttcctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:345‑M1/121‑150 (MQ=255) ggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGggttt > 1:923930‑M1/121‑146 (MQ=255) ggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGggttt < 2:923930‑M1/28‑3 (MQ=255) ccTAAGGCGGCTACTGAGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:1223560‑M1/150‑1 (MQ=255) gtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 2:1689498‑M1/120‑150 (MQ=255) gtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 2:980742‑M1/31‑1 (MQ=255) gtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 1:1015850‑M1/31‑1 (MQ=255) agcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgtgggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:2381252‑M1/117‑150 (MQ=255) gcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTCGCCTGTGc > 2:2044210‑M1/116‑125 (MQ=255) gcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTCGCCTGTGc < 1:2044210‑M1/10‑1 (MQ=255) cgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:481328‑M1/36‑1 (MQ=255) gagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtgggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1014156‑M1/37‑1 (MQ=255) gagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1458867‑M1/114‑149 (MQ=255) tACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaaca > 1:979988‑M1/1‑146 (MQ=255) ctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:1809766‑M1/24‑1 (MQ=255) 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agccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 2:540592‑M1/86‑150 (MQ=255) agccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 1:980742‑M1/86‑150 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcggg > 1:727747‑M2/1‑142 (MQ=255) gccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:2087179‑M1/85‑150 (MQ=255) tgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGCGATGGCAAGGAGAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggt > 2:1882411‑M2/1‑141 (MQ=255) 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gcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTAc > 2:1024897‑M1/80‑150 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttac < 1:618029‑M1/147‑35 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttac > 2:618029‑M1/1‑113 (MQ=255) cgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGc > 2:2069056‑M1/75‑78 (MQ=255) cgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGc < 1:2069056‑M1/4‑1 (MQ=255) ctcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC > 2:2385196‑M1/1‑103 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:979988‑M1/150‑42 (MQ=255) gtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggtttgcattgaaggtctcttgattggagtt < 2:1638759‑M1/2‑1 (MQ=255) gtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggtttgcattgaaggtctcttgattggagtt > 1:1638759‑M1/72‑73 (MQ=255) ggTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaaga < 1:1835256‑M1/150‑44 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 2:2106196/111‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt > 1:2106196/1‑111 (MQ=255) gcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 2:411160‑M1/50‑114 (MQ=255) gcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg < 1:411160‑M1/65‑1 (MQ=255) aaaGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacc > 1:2185210‑M2/1‑102 (MQ=255) ccTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagc < 1:379020‑M1/98‑27 (MQ=255) cTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGC < 2:685108‑M1/38‑1 (MQ=255) cTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGC > 1:685108‑M1/1‑38 (MQ=255) tATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcg > 2:681446‑M2/1‑91 (MQ=255) aaaCACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATcc < 2:1988409/80‑1 (MQ=255) aaaCACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATcc > 1:1988409/1‑80 (MQ=255) ttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 1:211210‑M1/11‑90 (MQ=255) ttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:211210‑M1/80‑1 (MQ=255) aGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagagg > 2:839971‑M2/1‑63 (MQ=255) aGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagagg < 1:839971‑M2/87‑25 (MQ=255) | GTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG > NC_002947/5201480‑5201708 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |