| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5202422 | 79 (0.850) | 6 (0.070) | 6/240 | NT | 6.7% | coding (681/2043 nt) | PP_4583 | putative Peptidase |
| ? | NC_002947 | = 5202478 | 91 (1.020) | coding (737/2043 nt) | PP_4583 | putative Peptidase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCAACTCGACG > NC_002947/5202275‑5202570 | cAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTc < 1:1281977/150‑1 (MQ=255)cAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTc > 1:1940744/1‑150 (MQ=255)cAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAAAAAGATGTGGGTTTCGTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTc > 1:531972/1‑150 (MQ=255)cAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCATGGG‑CACCTGCGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTc > 2:790368/1‑150 (MQ=255) aaCGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTcc > 1:341666/1‑150 (MQ=255) aaCGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTcc > 1:1928592/1‑150 (MQ=255) aaCGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGGGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTcc > 1:633803/1‑150 (MQ=255) gACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAg < 2:721829/150‑1 (MQ=255) gACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAg < 1:1429644/150‑1 (MQ=255) aGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGc > 1:899920/1‑150 (MQ=255) gACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCt < 2:633803/150‑1 (MQ=255) aCGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACCAGACGCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTg > 1:1641023/1‑150 (MQ=255) cGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTgg < 1:1937737/150‑1 (MQ=255) 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cgacACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGac < 2:1310401/150‑1 (MQ=255) acccaccGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAg < 1:888629/114‑1 (MQ=255) acccaccGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAg > 2:888629/1‑114 (MQ=255) acccaccGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGaccacc > 1:1402322/1‑150 (MQ=255) ccaccGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCacccaggcctcgctggtggtcttgctgttcagcagcagcaccag > 1:476824‑M1/1‑106 (MQ=255) ccaccGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGa < 1:2198796/111‑1 (MQ=255) 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cGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGaa < 1:885367/150‑1 (MQ=255) gTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCa < 1:740210/117‑1 (MQ=255) gTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCa > 2:740210/1‑117 (MQ=255) ttcCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTc > 2:517555/1‑150 (MQ=255) cTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTcccc > 2:2422403/1‑150 (MQ=255) tGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGcgcc > 1:1956266/1‑121 (MQ=255) tGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGcgcc < 2:1956266/121‑1 (MQ=255) tGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCg > 1:1961500/1‑150 (MQ=255) tGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCg > 1:2391615/1‑150 (MQ=255) tGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCg > 1:1269885/1‑150 (MQ=255) cACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGAc > 2:1925112/1‑150 (MQ=255) cTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCa < 2:899920/150‑1 (MQ=255) gCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATg < 2:1487512/150‑1 (MQ=255) tctaCCAGCTCCTATCGCCAGATGGTGCTGTTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCaa < 2:300665/147‑1 (MQ=255) cGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCaa < 1:590738/150‑1 (MQ=255) gacCAGCacccaggccgcgcttgtggtcttgctgttccgcagcagcaccagctggcgctcggagctggtgcggtagcagtgcaggaagaaacgcccatctggctcttcgaacacggtgtgcgcggcgtcggtgcccaaggtgtggcgacg > 2:1332515‑M1/2‑7 (MQ=255) ccAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACGACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCAAcaga > 1:300665/1‑147 (MQ=255) cAGCacccaggcctcgctggtggtctagctgttcagcagcagcaccagctggcgctcggagctggtgcggtagcagtgcaggaagagacgcccatctggctcttcgaacacggtgtgcgcggcgtaggcgcccaaggtgtggcgacgcag > 2:1210828‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTgctggtgcggtagcagtgcaggaagaaacgcccatctggctcttcgaacacg > 1:1833732‑M2/1‑60 (MQ=255) cAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTgctggtgcggtagcagtgcaggaagaaacgcccatctggctcttcgaacacg < 2:1833732‑M2/112‑53 (MQ=255) aGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCAACTCGAc > 1:2293577/1‑150 (MQ=255) gCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTgctggtgcggtagcagtgcaggaagaaacgcccatctggctcttcgaacacggtgtgcgcggcgtcggtgcccaaggtgtggcgacgcaggc < 2:476824‑M2/150‑93 (MQ=255) | CAACGACAGCCAGACGCTCTTCTTCGCAGAGCTGGACGACACCCACCGCCCATGGCGCCTGCGTCGCCACACCTTGGG‑CACCGACGCCGCGCACACCGTGTTCGAAGAGCCAGATGGGCGTTTCTTCCTGCACTGCTACCGCACCAGCTCCGAGCGCCAGCTGGTGCTGCTGCTGAACAGCAAGACCACCAGCGAGGCCTGGGTGCTGGACGCCGAAACCCCGCAGGCGCCGTTCACCTGCCTGGCGCCGCGCGTCGAAGGCCACGAATACTTCCCCGACCATGGCCAACTCGACG > NC_002947/5202275‑5202570 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |