| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5724339 | 32 (0.340) | 14 (0.190) | 11/202 | NT | 28.9% | intergenic (‑185/+109) | PP_5024/opgH | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein/glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
| ? | NC_002947 | = 5724358 | 43 (0.570) | intergenic (‑204/+90) | PP_5024/opgH | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein/glucans biosynthesis glucosyltransferase H | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGGGT > NC_002947/5724193‑5724488 | gtgtTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGTTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAg < 1:261378/150‑1 (MQ=255)gtgtTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAg < 2:1310354/150‑1 (MQ=255) ttGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGc > 1:2006437/1‑150 (MQ=255) tGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCa < 2:863095/150‑1 (MQ=255) cACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCAtgt < 2:1358032/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCAtgtg < 2:1614837/150‑1 (MQ=255) cGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATgtgt < 1:1135747/150‑1 (MQ=255) ccGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATc > 2:1645213/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATccc < 1:118380/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGgta > 2:1863096‑M2/1‑147 (MQ=255) gCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGgtag < 2:54955‑M2/150‑5 (MQ=255) gCCGAAGCGTCGTACAGCAGAAATAAACCAACTCAGTGCTGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGgtag > 1:1107997‑M2/1‑146 (MQ=255) cGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgcccttgtagga < 1:2210710‑M1/150‑26 (MQ=255) gAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgccctt > 2:463519‑M1/1‑124 (MQ=255) gAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgccctt < 1:463519‑M1/143‑20 (MQ=255) aaGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgcccttgtaggagc < 1:959857‑M1/150‑28 (MQ=255) aaGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGgtaggagc > 1:1501468‑M2/1‑142 (MQ=255) aaGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGgtaggagc > 1:1433593‑M2/1‑142 (MQ=255) 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gCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgcccttgtaggagcgg > 1:1665645‑M1/1‑52 (MQ=255) cAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgcccttg > 1:2159317‑M1/1‑50 (MQ=255) cAAAATGAGGGGGTGAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACcagggatacacatgcccttg < 2:2159317‑M1/70‑21 (MQ=255) aaTGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 2:586489/1‑91 (MQ=255) aaTGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:586489/91‑1 (MQ=255) aaTGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGa < 2:212369/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCggg > 1:1196001/1‑125 (MQ=255) 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cTACcagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctaggtccacgggcagcactgagttggtttatttctgctgtacgacgcttcggc > 1:1107997‑M1/1‑4 (MQ=255) cTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGCGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTAAg > 2:755049/1‑150 (MQ=255) cTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAg < 1:968303/150‑1 (MQ=255) cTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAg < 1:2311348/150‑1 (MQ=255) cTACAAGGGCATGTGTACCCCTGGTAGGAGCGGGTGCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGACCCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAg < 1:968858/150‑1 (MQ=255) tACcagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctaggtccacgggccgccatgcgttagcatccctctccgatacgacgcttcggcc > 2:1863096‑M1/1‑3 (MQ=255) tACNAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCTACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAgg > 2:1504600/1‑150 (MQ=255) aCcagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctag < 1:2424728‑M1/98‑97 (MQ=255) aCcagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctag > 2:2424728‑M1/1‑2 (MQ=255) ccagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctaggtccacgggccgc < 1:1847350‑M1/110‑110 (MQ=255) ccagggatacacatgcccttgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttggccaacaaagtccccctgcggctctaggtccacgggccgc > 2:1847350‑M1/1‑1 (MQ=255) cAAGGGCATGTGTATCCCTGgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctcaccccctcattttg < 2:2159317‑M2/70‑51 (MQ=255) cAAGGGCATGTGTATCCCTGgtaggagcgggttcacccgcgaagctttttggcctaaccccctcattttg > 1:2159317‑M2/1‑20 (MQ=255) cAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGGGt > 2:1628459/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGGGt > 1:498984/1‑150 (MQ=255) | GTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAATGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGGGT > NC_002947/5724193‑5724488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |