| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5756570 = | 109 (1.170) | 5 (0.060) | 4/240 | NT | 5.3% | intergenic (+191/‑497) | glnG/PP_5050 | two‑component system DNA‑binding response regulator GlnL/GlnG/transposase |
| ? | NC_002947 | 5756612 = | 74 (0.830) | intergenic (+233/‑455) | glnG/PP_5050 | two‑component system DNA‑binding response regulator GlnL/GlnG/transposase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGC > NC_002947/5756422‑5756718 | ccgcgatgtgtgtccacgccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcgcggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgaccccgatatgtgcccacc < 2:1430007‑M1/2‑1 (MQ=255)ccATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGGTGCTgcc > 2:1358412/1‑150 (MQ=255) gcgACACAGGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCAc > 2:1056887/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGGGAGTTTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTc > 1:1730807/1‑150 (MQ=21) aGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcg > 1:659950/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgcg < 2:932806/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgcg > 2:384404/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCgg < 1:1533067/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCgg < 1:1440520/150‑1 (MQ=255) ccACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCGGATGCGGTGGACACACAGCGCGGCGGTCGTAGAAGCGGGTTCACCCGCGCAGAGGCCAGGCCTGCCGGCCAATCTGCACCTGCCGCACCCCGTTGCAGCCGCCACCGCATTCGCggacaacg > 1:216564/1‑144 (MQ=255) cacaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAcc > 2:67053/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAcc > 1:1717403/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTACCGCCACCGTATTCGCGTGTAAAcc > 2:687483/1‑150 (MQ=255) acaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGtttaccc > 2:2404366/1‑144 (MQ=255) acaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc > 1:477860/1‑150 (MQ=255) acaGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc < 2:1284809/150‑1 (MQ=255) aGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCcgc < 2:756191/150‑1 (MQ=255) aGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCAGTGCTTCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCcgc > 2:562832/1‑150 (MQ=255) cACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTTTACCcgcgaata < 1:1273602/150‑5 (MQ=255) aCCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTAc < 1:1166963/150‑1 (MQ=255) tctGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCcgc > 2:1649875/1‑141 (MQ=255) tctGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAc > 2:1681395/1‑150 (MQ=255) tctGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAc > 1:2355409/1‑150 (MQ=255) cccccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAcggcg < 1:266483/150‑1 (MQ=255) cccccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAcggcg > 1:2293681/1‑150 (MQ=255) ccccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATGGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACCAcggcgg > 2:1256365/1‑150 (MQ=255) ccccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAcggcgg > 2:2087958/1‑150 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTTTACCcgcgaatacg < 1:1146663/142‑7 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTTTACCcgcgaatacg > 2:1146663/1‑136 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAc < 1:1612000/131‑1 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAc > 2:1612000/1‑131 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGt < 2:2013808/150‑1 (MQ=255) cccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGATCTAGAGCCGGGAGCGCCCGGAAAGAGGCCAGGCGCCCGGGTAGATATCAAAGGTCCGTTCCGCGTTAGCGCCGCCACCGTAGTCGCGCGTAAACCCGCTCCTACCACGCCGGt > 2:73587/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgc > 2:2218196/1‑122 (MQ=255) ccAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgc < 1:2218196/122‑1 (MQ=255) cAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCTGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTgg < 1:2314053/150‑1 (MQ=255) aaGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTggg < 1:67053/150‑1 (MQ=255) ggCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGca < 1:2211129/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGATGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACatat > 1:2016887/1‑150 (MQ=255) gACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACCTACCGGGgtcg > 1:553833/1‑150 (MQ=255) gACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCACCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGgtcg < 1:1056887/150‑1 (MQ=255) cacacaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGgtcgtc < 1:327690/150‑1 (MQ=255) acacaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATc < 2:192230/140‑1 (MQ=255) acacaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATc > 1:192230/1‑140 (MQ=255) acacaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGtcgtcg > 1:974529/1‑150 (MQ=255) acaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa < 2:1086930/107‑1 (MQ=255) acaTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa > 1:1086930/1‑107 (MQ=255) caTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGTGTCGTCGTAg < 2:477860/150‑1 (MQ=255) caTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAg > 1:2050992/1‑150 (MQ=255) caTCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAg < 1:384404/150‑1 (MQ=255) ggcaggtggagattggccagcaggcgcggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgaccccgatatgtgcccaCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGt < 1:2096646‑M1/43‑1 (MQ=255) ggcaggtggagattggccagcaggcgcggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgaccccgatatgtgcccaCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGt > 2:2096646‑M1/78‑120 (MQ=255) gtcgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCggg < 2:49161/150‑1 (MQ=255) tcgtcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCACTCCCCACCTGCCGCTCACCGTCGCTGCCCCCACCGTATTCGCACCTGGTCTGTGTGCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGt < 1:1356410/150‑1 (MQ=17) tcgtcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGt < 1:1470897/150‑1 (MQ=255) cgtcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGtt < 1:2087958/150‑1 (MQ=255) gtcgtAGGAGCTGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTc < 2:2016887/150‑1 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCCCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCAcc < 1:562832/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa > 2:1166021/1‑89 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:1468290/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:1546479/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg < 2:2050992/150‑1 (MQ=255) tttaCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa > 2:830424/4‑82 (MQ=255) tttaCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa < 1:830424/79‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCgg > 1:76230/1‑77 (MQ=255) tCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAACCTCCACCTGCCGTCCACCGTTGCTGCCGCCACCGTCTCCGCGGGTACACCCGCGCCTACCACGGCCGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGcc < 1:1358412/150‑1 (MQ=17) ccGCGAGGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCCCCCCCCGCCGGTCCCCTTGGCTGCCCCCCCCGTATCCCCGAGTTCACCCGCGCCTGCCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgcgc < 1:1277891/150‑1 (MQ=17) ccGCGACAATGCTGGGGCTGCCGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgcgc < 2:1996492/150‑1 (MQ=17) ccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:657206/135‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgcgc > 2:2087527/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgcgc > 2:1925496/1‑150 (MQ=255) ggacagtgCCGGGCCTGCTGGGCCATCCCCCGCTGCCGTTCACCCTTGCTGCCCGCACCGTATGCGCGGCTCAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCCTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCctg < 2:829070/143‑1 (MQ=17) ttcgcgggtgaacccgctcctacgacgaccccgatatgtgcccaCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCggg < 2:1052583‑M1/57‑1 (MQ=255) ttcgcgggtgaacccgctcctacgacgaccccgatatgtgcccaCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCggg > 1:1052583‑M1/45‑101 (MQ=255) gCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTTTACCcgc > 1:1055996/1‑72 (MQ=14) gCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTTTACCcgc < 2:1055996/72‑1 (MQ=255) gCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGAGCTCAGAACGGCGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAGGAGGCCGCGCcggcggcccc > 2:971413/1‑144 (MQ=17) gCCTGCTGGCCAATCTCCACGTCCCGTCCACCGGTGCTGCCGCCACCGTATGCGCGAGTAAACCCGCGCCTGCCACGGCGGTGGGCACATATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAAtctc < 2:752156/150‑1 (MQ=14) gCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGGGGGCCCATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGATCACCCGCGAAGAGGCCGCTCCTGCTGGCCAAtctc > 2:1224141/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTcc < 1:1256365/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCgggg < 1:2029069/94‑1 (MQ=255) ccggCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCTCCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCt < 1:814520/148‑1 (MQ=255) tgGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCAACCTg > 1:203237/1‑150 (MQ=255) gCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc < 1:710464/57‑1 (MQ=255) gCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc > 2:710464/1‑57 (MQ=255) gCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGcc > 2:799531/1‑150 (MQ=255) cAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCgg > 2:1115184/1‑47 (MQ=255) cAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCgggg < 1:1878740/87‑1 (MQ=255) cAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGt > 1:1430007/1‑150 (MQ=255) aaTCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACGCGAGCCCACCGCGGCGGGGAGCACAGAACGCGCTCGTGTTAGTCGCGGTGGCACCCGCAACATGACCGCACCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGtt > 2:1019325/1‑150 (MQ=9) ctcCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAg > 2:189637/1‑150 (MQ=255) tcCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCAc > 2:395393/1‑138 (MQ=255) tcCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCAc < 1:395393/138‑1 (MQ=255) ccACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCg > 1:2404851/1‑150 (MQ=255) ccACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCg > 2:2132417/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGGGGGCAGACTTCGGGGGCGTCGGAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCCCCACCTCCCGTCCAGCGTTgcc > 1:1680945/1‑150 (MQ=14) cGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTgccgcc < 1:1681395/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAcggcgg > 2:1066880/1‑51 (MQ=38) ccGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAcggcgg < 1:1066880/51‑1 (MQ=35) cGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGGCCGCGGCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGGTCAGCGTTGGCGCCGCCACCg > 2:142803/1‑150 (MQ=255) | CCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGATCACCTCTGCCCCCAAGGCTGATGCGGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGC > NC_002947/5756422‑5756718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |