New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 594774 = | 133 (1.430) | 13 (0.150) | 6/228 | NT | 10.0% | intergenic (‑10/+117) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 594859 = | 114 (1.340) | intergenic (‑95/+32) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGGGTA > NC_002947/594712‑595008 | cggcCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAgg < 1:151133/150‑1 (MQ=255) ggcCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGc < 2:2262060/150‑1 (MQ=255) cccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCgg < 2:942476/150‑1 (MQ=255) ccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGt > 2:1529580/1‑150 (MQ=255) ccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGt < 2:1557340/150‑1 (MQ=255) aTAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGa > 1:1911084/1‑150 (MQ=255) gagagGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGTCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 1:1559182/149‑1 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCATCTGCATGTGCATTGCCTGCCTCTTCGCGGGCATGCCCTCGCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGTGAGCGGGCTTTCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa < 2:2333653/150‑1 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa > 1:1938200/1‑150 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGACATTGCACCAGCTCGAAAGCCGGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa < 2:1663033/150‑1 (MQ=39) cGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGAt < 1:682661/150‑1 (MQ=255) cGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGAt < 1:520780/150‑1 (MQ=255) gCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATc < 2:8174/150‑1 (MQ=255) ccTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATc < 2:612319/149‑1 (MQ=255) cTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCa > 1:180143/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCAt > 1:2083159/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTa > 2:778382/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTa < 2:2144901/150‑1 (MQ=255) 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cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatga > 1:847168/1‑150 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatga > 2:1398528/1‑150 (MQ=255) tgcttcgcgggcacgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGGGTTTGATCATTACGCGCACGCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATa > 2:2231945‑M2/25‑150 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCTGCCCCCAGGATGATa < 1:433762/150‑1 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATa < 1:819980/150‑1 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATa < 2:1972645/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCg < 2:1919137/87‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCaa < 1:1067213/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGt < 2:143575/150‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTc > 2:55904/1‑150 (MQ=255) cccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCAt < 2:1057639‑M2/141‑1 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTca < 2:1628356‑M2/57‑1 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGga > 1:1761310‑M2/9‑129 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGga < 2:1761310‑M2/121‑1 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCAtt < 1:1190633‑M2/142‑1 (MQ=255) cgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTc < 1:807156‑M2/143‑1 (MQ=255) cgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCAt < 1:1723655‑M2/145‑1 (MQ=255) aagCAGGCGGTGGGGTGCGTGACCGGTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CACCGGTATCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCACAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATgg < 1:2368329‑M2/147‑1 (MQ=255) aagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATgg < 2:218102‑M2/147‑1 (MQ=255) aagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGCAAAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCACAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATgg < 1:2366782‑M2/147‑1 (MQ=255) | GCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGC‑CAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGGGTA > NC_002947/594712‑595008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |