New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAG > NC_002947/608571‑608867 | cagcagTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCca > 1:32510/1‑150 (MQ=255) acgaTCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGACAGGGATCGGACGTTGTACACGCTCGGTAGACGCCAGGTGGTGACCGACGACGTGTCCTTTAGCTCGGCGGAGAATGTGTTTGCCGTCCTGTTCCT‑‑GCCGGGTCCACAgg > 1:2180692/4‑150 (MQ=255) gCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGt < 1:11203/150‑1 (MQ=255) gCGTGACGAACCCTTGCACGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGt < 1:1942392/150‑1 (MQ=255) gAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTcc > 1:2135909/1‑150 (MQ=255) gAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGCTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTcc > 2:2281965/1‑150 (MQ=255) aaCCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGGGAATGTAGAGTCCg > 1:833029/1‑150 (MQ=255) cccTTGCCGCTCTGTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTAGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGAGCGCGATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑CCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGtg < 2:1093090/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGtgc > 1:1420231/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGtgctgctgc < 1:1231087/150‑1 (MQ=255) ttttATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAt > 1:117454/1‑150 (MQ=255) ttATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATcc > 1:96607/1‑150 (MQ=255) ttATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATcc > 2:151156/1‑150 (MQ=255) ttATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATcc > 2:1692339/1‑150 (MQ=255) tccAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGGATGTAGAGTTCGTGCTGCTGCGTGATCCGc > 1:1542691/3‑150 (MQ=255) aTCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGc < 2:483036/150‑1 (MQ=255) tCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGAGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCa < 2:1115990/150‑1 (MQ=255) cAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAg < 2:833029/150‑1 (MQ=255) 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2:2005141‑M2/22‑94 (MQ=255) gccggctggccaaggtcggcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTgg < 1:2005141‑M2/73‑1 (MQ=255) CGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAg > 1:1956780‑M1/1‑103 (MQ=255) CGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAg < 2:1956780‑M1/103‑1 (MQ=255) CGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTggtggt < 2:1140539‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAg > 2:1109361/1‑111 (MQ=255) cTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAg < 1:1109361/111‑1 (MQ=255) cTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCg > 1:81811/1‑150 (MQ=255) ggCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGAc < 1:1190508/150‑1 (MQ=255) gCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTc > 2:381780/1‑111 (MQ=255) gCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTc < 1:381780/111‑1 (MQ=255) gCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACa > 2:1067489/1‑150 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATGCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACaaa < 2:1596304/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGAAAGGCCCGCGAGCA‑AGTCGGTGCAGTGCCTTATGGTCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAggg < 1:647450/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAACAGGTGAAGGGAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAggg < 2:61235/150‑1 (MQ=255) cggcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGc < 1:215379‑M2/145‑1 (MQ=255) cggcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGc < 1:2044825‑M2/145‑1 (MQ=255) ggcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCTCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCt < 2:417683‑M2/146‑1 (MQ=255) ggcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCt < 2:2144044‑M2/146‑1 (MQ=255) gcgCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTg < 2:2202500‑M2/147‑1 (MQ=255) gCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGa < 1:1624054‑M2/149‑1 (MQ=255) ccACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAg > 2:1531834/1‑150 (MQ=255) | CAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGG‑GCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAG > NC_002947/608571‑608867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |