New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 726899 = | 89 (0.950) | 6 (0.070) | 5/222 | NT | 7.0% | intergenic (‑143/+124) | PP_0620/PP_0621 | GntR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 726986 = | 81 (0.980) | intergenic (‑230/+37) | PP_0620/PP_0621 | GntR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726837‑727134 | ggTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGa < 1:1926571/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCCTACACCGTGGTGACTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAt > 2:1142884/1‑150 (MQ=255) aTGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGaaa < 1:2301873/150‑2 (MQ=255) tgAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGCGTTCGAATTGGttt > 2:17697/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACAGCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCa > 1:720912/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAtt < 1:354400/143‑1 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAtt > 2:354400/1‑143 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCa > 2:2286838/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCa > 1:2318190/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCa > 2:1200651/1‑150 (MQ=255) aaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAg < 1:230077/150‑1 (MQ=255) aaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAg < 2:1656325/150‑1 (MQ=255) gggTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGa < 2:1418610/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGAGGGGGTAGGGGGAGCACTACATTGCAGACAAAACCGGTGGGGGCGGGCGTGCACGCGAACACCGGCGAAGCCGGGGCCATTCCCCGTGGTGCCTGTTTCGCGGCCAAGTCCGCTCCCACAGATTTTGAATTGGTTTCAGGA‑t < 2:433409/150‑1 (MQ=16) ggggAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGaa < 2:1686737/150‑1 (MQ=255) gagggaTATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAg > 1:1884012/1‑150 (MQ=255) ggaTATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACa > 2:1460929/1‑150 (MQ=255) gaTATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAt < 2:1926823/150‑1 (MQ=255) acaagtgGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGAAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑c < 1:2343382/146‑1 (MQ=255) tgtgGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑Cgtg > 1:2365690/1‑150 (MQ=255) tgGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGtt > 2:1488405/1‑150 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGaa > 1:1542680/1‑118 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGaa < 2:1542680/118‑1 (MQ=255) gAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtg < 1:313854/150‑1 (MQ=255) gAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtg > 2:1802548/1‑150 (MQ=255) aaTTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtggt < 1:2001401/150‑1 (MQ=255) cAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCa < 1:833017/150‑1 (MQ=255) cAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCa < 1:1460929/150‑1 (MQ=255) aGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAtt < 1:775509/106‑1 (MQ=255) aGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAtt > 2:775509/1‑106 (MQ=255) aGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑Cgt > 1:432561/1‑131 (MQ=255) aGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑Cgt < 2:432561/131‑1 (MQ=255) aGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAg < 2:2400057/150‑1 (MQ=255) gATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAgg < 1:1140289/150‑1 (MQ=255) aTAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACCACCCGCGCAAAAGGTGCAAGACAAAGAGATACCCTCTGCACAGGCATGCCCGCCCCCGCAGAGTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAggg > 2:2102769/1‑150 (MQ=255) tAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGc < 1:2286838/150‑1 (MQ=255) aaaCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtggtg < 1:2068761/139‑1 (MQ=255) aaaCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtggtg > 2:2068761/1‑139 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCctgct > 1:330869‑M1/1‑150 (MQ=255) GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtgg > 2:2382162‑M1/1‑130 (MQ=255) GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTtgg < 1:2382162‑M1/130‑1 (MQ=255) GAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGt < 2:106370‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTg > 1:1167984‑M1/1‑150 (MQ=255) gcttgcccgcgaagcaggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCt > 1:1301555‑M2/76‑150 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCt > 1:1350751‑M1/1‑150 (MQ=255) gTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTgg < 1:1802548/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCt < 1:1119055/150‑1 (MQ=255) cccgcgaagcaggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTg > 2:776074‑M2/71‑150 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCGGCTGCAGGTGGGCCTGGCTg < 1:1142884/150‑1 (MQ=255) ccgcgaagcaggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGAc > 2:580832‑M2/70‑99 (MQ=255) ccgcgaagcaggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGAc < 1:580832‑M2/30‑1 (MQ=255) ccgcgaagcaggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGc > 1:1156617‑M2/70‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGc > 1:1432463/1‑150 (MQ=255) gAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCa > 1:93303/1‑118 (MQ=255) cacCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGt > 2:2224425/1‑131 (MQ=255) caggcaccacggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcacgcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCAc < 2:1156617‑M2/89‑1 (MQ=255) acCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCAc > 2:2251627/1‑150 (MQ=255) ccGGCGACGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTCCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGTACAGCCAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACt < 2:155527/150‑1 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCa > 1:1704924/1‑147 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCa < 2:1704924/147‑1 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTc > 2:2106712/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTgg < 1:1150604/129‑1 (MQ=255) ggCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTgg > 2:1150604/1‑129 (MQ=255) gCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAg < 2:863561/111‑1 (MQ=255) gCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAg > 1:863561/1‑111 (MQ=255) cGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctg > 1:1184050/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctg > 1:2273579/1‑150 (MQ=255) ggTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGCTTCAGGA‑TTGAACACAAAC‑GGCCTAGATCGGAGGTGGCCAGGTCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACACATTGCCctgc > 1:542583/1‑150 (MQ=255) ggTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCAGCTCCCACAGATTTCGAATTGGATTCAGGA‑TTGAACAAACCTGATTTTTCATTGTT‑ATTGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCAATCATTGCCctgc > 1:542782/1‑150 (MQ=255) tGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctgctg > 1:669555/1‑150 (MQ=255) tGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATGTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctgctg > 1:1624372/1‑150 (MQ=255) ccATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCa < 1:1488405/150‑1 (MQ=255) cATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAg > 1:1601199/1‑150 (MQ=255) aTACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAgc < 2:2325648/150‑1 (MQ=255) aTACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAgc > 1:1252299/1‑150 (MQ=255) cacCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGcc > 2:2251312/1‑150 (MQ=255) acCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGccc > 1:140313/1‑150 (MQ=255) acCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGccc > 2:1469889/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑Cgtg > 2:358850/1‑66 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑Cgtg < 1:358850/66‑1 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTgg < 2:2318190/150‑1 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCGCACTGCTTACGACTTGG‑TTCGGTACTGGGACTGGCAG‑CTTTGGCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCCGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTggg < 2:2365690/150‑1 (MQ=255) tGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAggg < 1:409998/84‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAgg < 2:1432463/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGt < 2:1601199/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTg > 2:2061680/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctgc < 2:874128/118‑1 (MQ=255) cAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCctgc > 1:874128/1‑118 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTgg > 2:1323193/1‑87 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgccg > 2:86828/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgccg > 2:87229/1‑150 (MQ=255) cccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCaa > 2:350783‑M2/14‑150 (MQ=255) cccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCaa < 2:1301555‑M2/137‑1 (MQ=255) ccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAAt < 1:839444‑M2/138‑1 (MQ=255) ccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAAt > 1:2058556‑M2/13‑150 (MQ=255) gctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATgg < 1:2251627‑M2/140‑1 (MQ=255) ctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATggg < 1:1188576‑M2/141‑1 (MQ=255) ccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTgg > 1:1462625‑M2/7‑77 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGCCCGTACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 1:1880621‑M2/5‑150 (MQ=255) gATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAgcgc < 1:2102769‑M2/149‑1 (MQ=255) | GGTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGA‑TTGAACAGACAT‑CGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726837‑727134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |